基于另一个关联数组制作关联数组

Question

我做了一个关联数组如下。给出一些细节，键指的是特定文件，因为我将在更大脚本的上下文中使用这个数组（其中包含文件的目录将是一个 getopts 参数）。

declare -A BAMREADS
echo "BAMREADS array is initialized"

BAMREADS[../data/file1.bam]=33285268
BAMREADS[../data/file2.bam]=28777698
BAMREADS[../data/file3.bam]=22388955

echo ${BAMREADS[@]}  # Output: 22388955 33285268 28777698
echo ${!BAMREADS[@]} # Output: ../data/file1.bam ../data/file2.bam ../data/file3.bam

到目前为止，这个数组的行为似乎符合我的预期。现在，我想基于这个数组构建另一个关联数组。具体来说：我的第二个数组将具有与第一个数组相同的键，但我想将这些值除以一个名为 $MIN.

的变量

我不确定以下哪种策略最好，而且我似乎都无法实现。

策略一：复制数组并修改数组？

MIN=33285268

declare -A BRAMFRACS
echo "BAMFRACS array is initialized"
BAMFRACS=("${BAMREADS[@]}")

echo ${BAMFRACS[@]}  # Output: 22388955 33285268 28777698
echo ${!BAMFRACS[@]} # Output: 0 1 2

这不是我想要的钥匙。即使它有效，我也需要对所有值执行我提到的操作。

策略2: 遍历第一个数组时构建第二个数组

MIN=33285268

declare -A BRAMFRACS
echo "BAMFRACS array is initialized"

for i in $(ls $BAMFILES/*bam)
do
    echo $i
    echo ${BAMREADS[$i]}
    BAMFRACS[$i] = ${BAMREADS[$i]} 
done

echo ${BAMFRACS[@]}
echo ${!BAMFRACS[@]}


# When I run this, I get the following error which I am unsure how to solve:

../data/file1.bam
33285268
script.bash: line 108: BAMFRACS[../data/file1.bam]: No such file or directory
../data/file2.bam
28777698
script.bash: line 108: BAMFRACS[../data/file2.bam]: No such file or directory
../data/file3.bam
22388955

更新更新了 strategy2，它的输出更清晰。谢谢

Answer 1

两者都

declare -A BRAMFRACS

应该是

declare -A BAMFRACS

也就是说，你在名称中多了一个 'R'，其中一个错误的原因是 BAMFRACS 是一个索引数组（默认），而不是关联数组。

在策略 2 中：

BAMFRACS[$i] = ${BAMREADS[$i]}

应该是

BAMFRACS[$i]=${BAMREADS[$i]

即 = 两边不允许有空格。 BAMFRACS[$i] 被视为命令，因为命令由空格分隔。

顺便说一句，

for i in $(ls $BAMFILES/*bam)

可以写成：

for i in "$BAMFILES"/*bam

尝试：

MIN=33285268

declare -A BAMFRACS

for key in "${!BAMREADS[@]}"
do
    val=${BAMREADS[$key]}
    BAMFRACS[$key]=$((val/MIN))
done

echo ${BAMFRACS[@]}  
echo ${!BAMFRACS[@]}

给出：

1 0 0
../data/file1.bam ../data/file2.bam ../data/file3.bam

基于另一个关联数组制作关联数组

Making associative array based on another associative array

arrays

bash

loops

associative-array