使用 ggplot 绘制 shapefile 和 gganimate 动画

Question

示例数据

library(raster)
library(ggplot2)

my.shp <- getData('GADM', country = 'FRA', level = 1)
plot(my.shp)

如果我想使用 ggplot 绘制此数据：

my.shp_f <- fortify(my.shp, region = "ID_1")
ggplot(data = my.shp_f, aes(long, lat, group = group)) + geom_polygon(fill = "grey80")

问题一：为什么行政边界消失了？

问题二： 我有另一个数据框，其中包含每个行政区划从第 1 天到第 365 天的 2 年每日降雨量数据。

rain.data <- data.frame(ID_1 = rep(my.shp@data$ID_1, each = 2 * 365),
                        year = rep(rep(1981:1982, each = 365), times = 2),
                        day = rep(1:365, times = 4),
                        rain = sample(1:20, replace = T, 2 * 365 * 2))

我想为这个形状文件创建一个每日降雨量的动画 1981 年第 1 天到 1982 年第 365 天。

我目前的总体方法是循环并将每天的降雨图保存为单独的 .png 文件，然后将这些文件堆叠为 .gif。但是，这导致我先保存 2 年 X 365 天的 .png 文件，然后将它们堆叠在一起。如果我有 30 年的数据，这就变得不可能了。我读了这篇关于 gganimate https://github.com/thomasp85/gganimate 的 post 并且想知道是否有人可以演示如何使用 gganimate 使用以上数据生成动画地图

Answer 1

这个答案有点把事情引向了不同的方向，但我想尝试一下 gganimate，这是一个很好的借口。我的修改主要是通过使用 sf 包和来自 ggplot2 的新 geom_sf Geom。我不喜欢 hacky date fixing，所以肯定可以改进。我也只绘制了日期的一个子集——您拥有的数据量可能需要一些时间，具体取决于您的设置。无论如何，这就是我要做的：

library(raster)
library(ggplot2)
library(sf)
library(dplyr)
library(lubridate)
library(gganimate)
library(rmapshaper)

my.shp <- getData('GADM', country = 'FRA', level = 1)

## Convert the spatial file to sf
my.shp_sf <- st_as_sf(my.shp) %>% 
  ms_simplify()

## Here is how to plot without the rain data
ggplot(my.shp_sf) +
  geom_sf()

## Convert your data into a date
## this is very hacky and coule be improved
rain.data <- data.frame(ID_1 = rep(my.shp@data$ID_1, each = 2 * 365),
                        year = rep(rep(1981:1982, each = 365), times = 2),
                        day = rep(1:365, times = 4),
                        rain = sample(1:20, replace = T, 2 * 365 * 2)) 

date_wo_year <- as.Date(rain.data$day -1, origin = "1981-01-01")
rain.data$Date = ymd(paste0(rain.data$year, "-",month(date_wo_year),"-", day(date_wo_year)))

## Join the rain.data with a properly formatted date with the spatial data. 
joined_spatial <- my.shp_sf %>% 
  left_join(rain.data)

## Plot the spatial data and create an animation
joined_spatial %>% 
  filter(Date < as.Date("1981-02-28")) %>% 
  ggplot() +
  geom_sf(aes(fill = rain)) +
  scale_fill_viridis_c() +
  theme_void() +
  coord_sf(datum = NA) +
  labs(title = 'Date: {current_frame}') +
  transition_manual(Date)

使用 ggplot 绘制 shapefile 和 gganimate 动画

Using ggplot to plot shapefile and gganimate for animation

r

shapefile

ggplot2

rgdal

gganimate