(如何)我可以使用 ddply 来汇总按两个因素分组的数据框?

(How) can I use ddply to summarize a dataframe grouped by two factors?

问题的简短版本: 如何使用 ddply 汇总按多个变量分组的数据框?

我目前使用这段代码按条件进行总结:

ddply(ExampleData, .(Condition), summarize,  Average=mean(Var1, na.rm=TRUE), SD=sd(Var1),N=length(Var1), Med =median(Var1))

如何调整代码以通过两个变量(条件和块)进行汇总?

所需的输出格式类似于:

  Condition Block Average SD  N Med
1         A     1    0.50 .. ..  ..
2         A     2    0.80 .. ..  ..
3         B     1    0.90 .. ..  ..
4         B     2    0.75 .. ..  ..

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带有示例数据的较长版本的问题。

数据框:

ExampleData <- structure(list(Condition = c("A", "A", "A", "B", "B", "B"), Block = c(1, 
2, 1, 2, 1, 2), Var1= c(0.6, 0.8, 0.4, 1, 0.9, 0.5)), row.names = c(NA, 
6L), class = "data.frame")

即:

  Condition Block Average SD N Med
1         A     1  0.6 
2         A     2  0.8
3         A     1  0.4
4         B     2  1.0
5         B     1  0.9
6         B     2  0.5

我知道有其他方法可以获取摘要,但如果我了解如何调整我拥有的功能,那将对我的学习有好处。 我只是没有成功让它工作,我找不到一个例子来帮助我在 Whosebug 上。我正在寻找类似的东西:

ddply(ExampleData, .c(Condition,Block), summarize,  Average=mean(Var1, na.rm=TRUE), SD=sd(Var1),N=length(Var1), Med =median(Var1))

(或.(条件*块)或列表(条件,块)或...??)

.variables参数中的c去掉,所以你的代码是:

library(plyr)
ddply(ExampleData, .(Condition, Block), summarize,  Average=mean(Var1, na.rm=TRUE), SD=sd(Var1),N=length(Var1), Med =median(Var1))

顺便说一句,您可能想改用 dplyr 而不是 plyrhttps://blog.rstudio.com/2014/01/17/introducing-dplyr/

如果您要在 dplyr 中执行此操作:

summarize(group_by(ExampleData, Condition, Block), Average=mean(Var1, na.rm=TRUE), SD=sd(Var1),N=length(Var1), Med =median(Var1))

你也可以使用管道,所以这可能是:

ExampleData %>% 
  group_by(Condition, Block) %>% 
  summarise(Average=mean(Var1, na.rm=TRUE), 
            SD=sd(Var1),
            N=length(Var1), 
            Med =median(Var1))