从 qsub 传递到 shell 脚本的未定义变量

Question

我在终端中运行有一个这样的脚本：

  for iter in 1
  do
    echo FullFilePath.sh $iter | qsub -V -e ~/pbs/ -o ~/pbs/
  done

在 shell 文件中，它看起来像这样：

matlab -nosplash -singleCompThread -nojvm -r "a=${iter}"

它运行很好，直到它在执行上面的 matlab 代码时出错，错误是我错误地使用了“=”运算符："a="。基本上 $iter 在 matlab 脚本运行时是未定义的。我已经尝试了很多版本并对上面的代码行进行了小的修改，但它总是出错......将不胜感激任何帮助。

Answer 1

在执行脚本之前，您需要 export 您的 iter 变量。

export iter

因此您的脚本可能如下所示：

for iter in {1..5}
do
    export iter
    sh FullFilePath.sh $iter | qsub -V -e ~/pbs/ -o ~/pbs/
done

或者您可以在 FullFilePath.sh 中添加一行以将变量设置为您的参数 (</code>):</p> <pre><code>iter=

Undefined vars passing from qsub to shell script