在记录链接库中检索匹配的记录 ID

Retrieving matched record ids in the recordlinkage library

我正在尝试这个例子:https://recordlinkage.readthedocs.io/en/latest/notebooks/data_deduplication.html

以下是代码片段:

import recordlinkage
from recordlinkage.datasets import load_febrl1

dfA = load_febrl1()

# Indexation step
indexer = recordlinkage.Index()
indexer.block(left_on='given_name')
candidate_links = indexer.index(dfA)

compare_cl = recordlinkage.Compare()

compare_cl.exact('given_name', 'given_name', label='given_name')
compare_cl.string('surname', 'surname', method='jarowinkler', threshold=0.85, label='surname')
compare_cl.exact('date_of_birth', 'date_of_birth', label='date_of_birth')
compare_cl.exact('suburb', 'suburb', label='suburb')
compare_cl.exact('state', 'state', label='state')
compare_cl.string('address_1', 'address_1', threshold=0.85, 
label='address_1')

features = compare_cl.compute(candidate_links, dfA)
matches = features[features.sum(axis=1) > 3]
print(len(matches))

我现在想单独打印已经 matched.I 尝试列出 'matches' 的列名的 record_ids,但 record_id 不是一部分它,我似乎无法找到完成它的方法(我只想要单独的 record_ids)

有没有办法检索 record_ids,也许可以单独打印它或将其存储为列表或数组?

不要忘记 Pandas 数据框除了其数据列外还有一个 "index"。通常这是一个 "extra" 列的整数或字符串,但更复杂的索引是可能的,例如"multi-index" 由不止一列组成。

如果你 print(matches.head()) 就可以看到这个。前两列的名称略有偏移,因为它们不是数据列;它们是索引本身的列。这个数据框索引实际上是一个包含两列的多索引:rec_id_1rec_id_2.

load_febrl 的结果将记录 ID 编码为 dfA 的索引。 Compare.compute 保留输入数据的索引:您总是可以期望原始数据的索引被保留为多索引。

可以使用 DataFrame.index 属性访问数据框本身的索引。这个 returns 一个 Index object (of which MultiIndex is a subclass) 又可以按如下方式转换:

  • Index.tolist():将其元素转换为listMultiIndex 变成 list of tuples
  • Index.to_series():将其元素转换为SeriesMultiIndex 变成 Series of tuples
  • Index.values:作为 NumPy ndarray 访问底层数据; MultiIndex 成为 tuplendarray
  • Index.to_frame():转换为DataFrame,索引列作为数据框列

因此您可以使用 matches.index 快速访问记录 ID,或使用 matches.tolist() 将它们导出到列表。

您还可以使用 matches.reset_index() 将索引列变回常规数据列。

这是使用 pandas 合并索引和 reset_index 属性

来完成答案的代码

这会将多索引转换为名为 level_0、level_1

的列
matches = matches.reset_index()

我们可以看到 level_0 列与 dfA

中的索引相同
matches.columns 
dfA.index

现在按索引将其与 dfA 合并 level_0

import pandas as pd
matched_dfA=pd.merge(matches,dfA,left_on='rec_id_1',right_index=True)

查看结果

matched_dfA.head()