KEGG注释

KEGG Annotation

我有一组基因(氨基酸序列)。我想找到基于 Kegg 的功能注释或 KO id。是否有任何 KEGG 数据库可供下载?我想对该数据库使用 blast。此外,我一直在寻找可以在这方面帮助我的 R 包。

希望我已经澄清了我的查询。提前感谢您的回复。

需要订阅 KEGG 数据库:

https://www.bioinformatics.jp/en/keggftp.html

价目表:

https://www.bioinformatics.jp/docs/subscription_schedule.pdf

如果您仍然感兴趣,这里是可用数据列表:

https://www.kegg.jp/kegg/download/

FASTA 序列在这里:

https://www.kegg.jp/kegg/download/Readme/README.fasta