如何衡量由层次聚类产生的两个聚类树之间的相似性?

How to measure similarity between two clustering trees that are produced by hierarchical clustering?

我想对不同的数据集应用层次聚类方法(即凝聚聚类)。我想比较结果的聚类树。有什么解决办法吗?提前致谢。

有很多方法可以做到这一点。 我建议您查看 dendextend 小插图中的 "comparing two dendrograms" 部分:

https://cran.r-project.org/web/packages/dendextend/vignettes/introduction.html#comparing-two-dendrograms

使用起来最简单的可能是 cor_cophenetic 函数。