在 xarray 中使用非索引坐标加入

Question

我正在尝试在 xarray 中执行 'join'，但在其中一项上使用了非索引坐标。我认为这应该不会太难，但我一直在旋转。

我在 'a' 上索引了一个数据集，在 'b' 上索引了一个数据集，在 'b' 上索引了一个 DataArray：

In [17]: ds=xr.Dataset(dict(a=(('x'),np.random.rand(10))), coords=dict(b=(('x'),list(range(10)))))

In [18]: ds
Out[18]:
<xarray.Dataset>
Dimensions:  (x: 10)
Coordinates:
    b        (x) int64 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9
Dimensions without coordinates: x
Data variables:
    a        (x) float64 0.3634 0.2132 0.6945 0.5359 0.1053 0.07045 0.5945 ...

In [19]: da=xr.DataArray(np.random.rand(10), dims=('b',), coords=dict(b=(('b'),list(range(10)))))

In [20]: da
Out[20]:
<xarray.DataArray (b: 10)>
array([0.796987, 0.275992, 0.747882, 0.240374, 0.435143, 0.285271, 0.753582,
       0.556038, 0.365889, 0.434844])
Coordinates:
  * b        (b) int64 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9

我可以通过加入 ds.b 等于 da.b 来将 da 添加到我的数据集吗？

这个和有点关系，但是我不想做任何运算，最后的结果应该是'a'维度，而不是'b'[=24] =]

谢谢！

编辑：根据@DSM 的要求，输出为：

<xarray.Dataset>
Dimensions:  (x: 10)
Coordinates:
    b        (x) int64 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9
Dimensions without coordinates: x
Data variables:
    a        (x) float64 0.3634 0.2132 0.6945 0.5359 0.1053 0.07045 0.5945 ...
    da       (x) float64 0.796987, 0.275992, 0.747882, 0.240374, 0.435143 ...

Edit2：这是一个带有字符串键的示例答案，其中 ds 只有键的子集。（如果 da 有一个子集，我不认为这种方法有效，但额外的对齐可能会有所帮助）

In [23]: da=xr.DataArray(np.random.rand(5), dims=('b',), coords=dict(b=(('b'),list('edcba'))))


In [27]: da
Out[27]:
<xarray.DataArray (b: 5)>
array([0.174843, 0.953963, 0.092538, 0.749569, 0.780823])
Coordinates:
  * b        (b) <U1 'e' 'd' 'c' 'b' 'a'


In [25]: ds=xr.Dataset(dict(a=(('x'),np.random.rand(4))), coords=dict(b=(('x'),list('abcd'))))


In [24]: ds
Out[24]:
<xarray.Dataset>
Dimensions:  (x: 5)
Coordinates:
    b        (x) <U1 'a' 'b' 'c' 'd' 'e'
Dimensions without coordinates: x
Data variables:
    a        (x) float64 0.7586 0.3529 0.5936 0.741 0.6344


In [26]: da.sel(b=ds.b)
Out[26]:
<xarray.DataArray (x: 4)>
array([0.780823, 0.749569, 0.092538, 0.953963])
Coordinates:
    b        (x) <U1 'a' 'b' 'c' 'd'
Dimensions without coordinates: x

Answer 1

如果您提供的不是 list/vector 个索引器，而是一个 DataArray，则该数组将重新整形为索引器的坐标：

In [5]: da.sel(b=ds.b)
Out[5]:
<xarray.DataArray (x: 10)>
array([0.327058, 0.904678, 0.455166, 0.67915 , 0.426856, 0.295434, 0.272206,
       0.630101, 0.447915, 0.157343])
Coordinates:
    b        (x) int64 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9
Dimensions without coordinates: x

您可以在作业中使用它在 ds.b 上加入 da：

In [6]: ds['da'] = da.sel(b=ds.b)

In [7]: ds
Out[7]:
<xarray.Dataset>
Dimensions:  (x: 10)
Coordinates:
    b        (x) int64 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9
Dimensions without coordinates: x
Data variables:
    a        (x) float64 0.9338 0.9901 0.4498 0.49 0.3023 0.2622 0.03598 0.2 ...
    da       (x) float64 0.3271 0.9047 0.4552 0.6791 0.4269 0.2954 0.2722 ...

More advanced indexing 上的 xarray 文档提供了此功能的一些很好的示例。

在 xarray 中使用非索引坐标加入

Join using a non-index coord in xarray

python-xarray