为什么 Nibabel 会更改我的文件的大小？

Question

我正在处理 nii.gz 格式的图像。因此，我使用 nibabel 来打开它们。问题是当我打开图像，将它们转换为 numpy 数组并将它们转换回 Nifti 格式时，输出大小发生了变化。顺序是：

nifti_image = nib.load('/my_path_to_image/image.nii.gz')
np_img = ct_images.get_fdata()
nifti_final = nib.Nifti1Image(data, affine=np.eye(4)) # Convert them to nifti
nib.save(nifti_final , 'image.nii.gz')

初始文件是~45 MB，在运行上面的代码之后，图像是~65 MB。我知道原始图像是 16 位编码的。我最初的理论是，当转换为 numpy 数组时，它们被编码为 64-bit，事实确实如此。所以我尝试了以下方法：

nifti_image = nib.load('/my_path_to_image/image.nii.gz')
np_img = ct_images.get_fdata()
np_img = np_img.astype(numpy.float16, copy=False)
nifti_final = nib.Nifti1Image(data, affine=np.eye(4)) # Convert them to nifti
nib.save(nifti_final , 'image.nii.gz')

但是，输出的大小仍然相同 ~65MB。知道为什么会这样吗？

Answer 1

您应该将原始 nifti 仿射和 header 信息添加到输出 nifti。例如，在您的情况下：

nifti_final = nib.Nifti1Image(data, nifti_image.affine, nifti_image.header)

为什么 Nibabel 会更改我的文件的大小？

Why does Nibabel change the size of my file?

python

numpy

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