如果大于 r 中的总和

sum if greater than in r

我有一个包含 145 行和超过 1000 列的数据框 (obs) 以及一个包含 145 个值 (thr) 的数值向量。

我想导出另一个包含 145 个元素的向量 (sumifs),其中每个元素都是 obs[n,] >= thr[n] 的值之和。

我想我可以 运行 一个 for 循环,其中单行总和的计算方式大致如下:

sumifs[n] <- if(obs[n,]>=thr[n],sum(obs[n,]))

但我也没能让它适用于单行。

我一直在查看其他建议使用 aggregate 或 plyr 包的问题,​​但我没有真正找到任何东西。

下面是一个只有 15 行 3 列的简化示例

c1 <- rep(1:5,3)
c2 <- rep(3:7,3)
c3 <- rep(2:6,3)

obs <- data.frame(r1,r2,r3)
thr <- c(2,2,3,3,4,4,5,5,2,2,3,3,4,4,5)

obs
   r1 r2 r3
1   1  3  2
2   2  4  3
3   3  5  4
4   4  6  5
5   5  7  6
6   1  3  2
7   2  4  3
8   3  5  4
9   4  6  5
10  5  7  6
11  1  3  2
12  2  4  3
13  3  5  4
14  4  6  5
15  5  7  6

因此,sumifs 应该是:

sumifs
5
9
12
15
18
0
0
0
15
18
3
7
9
15
18
#your data
DF <- as.data.frame(matrix(1:6, ncol = 2))
#turn into matrix
m <- as.matrix(DF)

#your threshold
thr <- c(3, 1, 7)

#compare
m >= thr
#        V1    V2
#[1,] FALSE  TRUE
#[2,]  TRUE  TRUE
#[3,] FALSE FALSE

#logical values get turned to 0/1 during arithmetics
#thus we can just multiply the matrix with the comparison
m * (m >= thr)
#     V1 V2
#[1,]  0  4
#[2,]  2  5
#[3,]  0  0

#and calculate the row sums
rowSums(m * (m >= thr))
#[1] 4 7 0