使用自动绘图功能修改 PCA 双标图上的点笔画

Question

我正在使用 autoplot 函数制作 PCA 双标图。就我而言，我想增加点笔画以提高情节的可读性。我该怎么做？

这是一个例子：

library(ggfortify)
df <- iris[c(1, 2, 3, 4)]
autoplot(prcomp(df), data = iris, colour="Species", fill="Species", shape="Species", geom="points", size=2) +
  scale_color_manual(values=c("#1B9E77","#D95F02","#7570B3")) +
  scale_fill_manual(values=c("#ffffff","#ffffff","#ffffff")) +
  scale_shape_manual(values=c(21:23))

Answer 1

我通过将最后一行代码添加到图中找到了问题的解决方案：

library(ggfortify)
df <- iris[c(1, 2, 3, 4)]
p <- autoplot(prcomp(df), data = iris, colour="Species", fill="Species", shape="Species", geom="points", size=2) +
  scale_color_manual(values=c("#1B9E77","#D95F02","#7570B3")) +
  scale_fill_manual(values=c("#ffffff","#ffffff","#ffffff")) +
  scale_shape_manual(values=c(21:23))
p$layers[[1]]$aes_params$stroke <- 2
p

使用自动绘图功能修改 PCA 双标图上的点笔画

Modify point stroke on a PCA biplot using autoplot function

r

ggplot2

ggfortify

biplot