rMATS 错误 "unable to access a shared library"
rMATS error "unable to access a shared library"
我正尝试在 Linux (CentOS) 集群上 运行 rMATS。在这个系统上,我没有 root 访问权限。我使用 anaconda conda install
包管理器安装了几个 rMATS 依赖包。
rMATS 无法访问系统上的共享库 libblas.so.3
并抛出错误 rMATSexe: error while loading shared libraries: libblas.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
尽管我已经在我的系统上找到了 libblas.so.3
库 /Users/paul/anaconda3/pkgs/lapack-3.6.1-1/lib/libblas.so.3
,但我不确定如何让 rMATS 软件将其作为 "shared library".
访问
我试过export LD_LIBRARY_PATH=/Users/ranum/anaconda3/pkgs/lapack-3.6.1-1/lib/libblas.so.3
,但是没用。
我可以把这个 libblas.so.3 库放在哪里以便系统可以找到它?
LD_LIBRARY_PATH
是目录路径而不是文件路径。你想这样设置:
LD_LIBRARY_PATH=/Users/ranum/anaconda3/pkgs/lapack-3.6.1-1/lib
我正尝试在 Linux (CentOS) 集群上 运行 rMATS。在这个系统上,我没有 root 访问权限。我使用 anaconda conda install
包管理器安装了几个 rMATS 依赖包。
rMATS 无法访问系统上的共享库 libblas.so.3
并抛出错误 rMATSexe: error while loading shared libraries: libblas.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
尽管我已经在我的系统上找到了 libblas.so.3
库 /Users/paul/anaconda3/pkgs/lapack-3.6.1-1/lib/libblas.so.3
,但我不确定如何让 rMATS 软件将其作为 "shared library".
我试过export LD_LIBRARY_PATH=/Users/ranum/anaconda3/pkgs/lapack-3.6.1-1/lib/libblas.so.3
,但是没用。
我可以把这个 libblas.so.3 库放在哪里以便系统可以找到它?
LD_LIBRARY_PATH
是目录路径而不是文件路径。你想这样设置:
LD_LIBRARY_PATH=/Users/ranum/anaconda3/pkgs/lapack-3.6.1-1/lib