当我在 Python 中有两个以上的组时,如何进行精确的 Fisher 检验?

How to conduct an exact Fisher test when I have more than two groups in Python?

我的数据如下:

prfs
ex  F   M
Pref        
C   11  20
B   15  6
A   3   5

我想做一个精确的 Fisher 检验。 scipy 中有一个函数,但只接受 2x2 列联表:

stats.fisher_exact(prfs, alternative = 'two-sided')
ValueError: The input `table` must be of shape (2, 2).

在 R 中有一个函数可以做到这一点,但是在 Python 中呢? 在 R:

fisher.test(prfs)
Fisher's Exact Test for Count Data

data:  prfs
p-value = 0.03261
alternative hypothesis: two.sided

scipy.stats.chi2_contingency() 是最接近的。