Sweave 诉 Knitr 诉 Rmarkdown：代码块 headers

Question

我正在尝试了解 rmarkdown、sweave 和 knitr 之间的关系。查看代码和示例我将运行分为两种类型的代码 headers 并且我不明白它们属于什么 language/package 。

headers是

```{}
```

和

<<>>=
@

它们有什么区别？
它们与 rmarkdown、sweave 和 knitr 有何关系？
如果我在 .rnw 上工作，我在使用哪一个？

Answer 1

sweave 和 rmarkdown 都提供了为 R、python 和其他编程语言运行任意代码的能力。各自的优缺点各不相同，但快速比较一下：

R 降价：

典型的文件扩展名：.rmd（不区分大小写），也许 .rmarkdown
支持 R、python 和 several other languages
输出到 HTML、docx、LaTeX（因此也是 PDF）和 several other output formats

使用三重反引号进行分块

  Regular text.

  ```{r chunkname, chunkoptions, ...}
  a <- 1
  ```

  ```{python pychunk, chunkoptions, ...}
      def myfun(v: list) -> list:
      """
      Something important in this docstring.
      """
      return [a+1 for a in v]
  ```

  More regular text.

因为是基于markdown，所以对于交叉引用，table-control等有一些限制；其中许多都有软件包和已知的缓解技术（太多无法在此处列出）。但是，您可以在 markdown 中使用直接的 LaTeX 格式，因此输出到 PDF 也可以享受该控制（尽管 LaTeX 代码未翻译为其他输出格式）。

挥动：

典型的文件扩展名包括 .rnw（不区分大小写），我见过 .noweb（对此不完全确定...）
支持 R，如果您可以通过 R 访问其他语言（例如通过 reticulate），可能还支持其他语言
输出到 LaTeX 和 PDF

使用<<>>=和@进行分块：

  Regular text.

  <<chunkname, chunkoptions, ...>>=
  a <- 1
  @

  More regular text.

因为它直接基于 LaTeX，所以您可以尽可能多地控制格式、交叉引用等

knitr

处理 sweave 和 rmarkdown 格式的文件
可能需要一些摆动预处理（例如，使用 Sweave2knitr），参考：https://yihui.name/knitr/demo/sweave/
rationale for knitr 是为了 "解决了Sweave中长期存在的一些问题，将其他附加包中的特性合并为一个包（knitr≈Sweave+cacheSweave+pgfSweave+weaver+animation::saveLatex+R2HTML::RweaveHTML+highlight::HighlightWeaveLatex + 0.2 * brew + 0.1 * SweaveListingUtils + 更多）。"

Sweave 诉 Knitr 诉 Rmarkdown：代码块 headers

Sweave v. Knitr v. Rmarkdown: code chunk headers

r

sweave

knitr

r-markdown