单步执行具有中间结果的管道

Stepping through a pipeline with intermediate results

有没有办法不用手动输出每一步流水线的结果? (例如,没有 selecting 和 运行ning 只有 selected 块)

我经常发现自己 运行逐行运行管道以记住它在做什么或何时进行某些分析。

例如:

library(dplyr)

mtcars %>% 
  group_by(cyl) %>% 
  sample_frac(0.1) %>% 
  summarise(res = mean(mpg))
# Source: local data frame [3 x 2]
# 
# cyl  res
# 1   4 33.9
# 2   6 18.1
# 3   8 18.7

我会 select 和 运行:

mtcars %>% group_by(cyl)

然后...

mtcars %>% group_by(cyl) %>% sample_frac(0.1)

等等...

但是 selecting 和 CMD/CTRL+ENTERRStudio 中留下了更有效的方法。

这可以用代码完成吗?

是否有一个函数需要一个管道,runs/digests 它逐行显示控制台中每一步的输出,然后您可以像 demos(...) 中那样按回车键继续examples(...) 个包指南

添加打印:

mtcars %>% 
  group_by(cyl) %>% 
  print %>% 
  sample_frac(0.1) %>% 
  print %>% 
  summarise(res = mean(mpg))

使用 magrittr 函数链很容易。例如定义一个函数 my_chain with:

foo <- function(x) x + 1
bar <- function(x) x + 1
baz <- function(x) x + 1
my_chain <- . %>% foo %>% bar %>% baz

并得到链的最终结果为:

     > my_chain(0)
    [1] 3

您可以通过 functions(my_chain) 获取函数列表 并像这样定义一个 "stepper" 函数:

stepper <- function(fun_chain, x, FUN = print) {
  f_list <- functions(fun_chain)
  for(i in seq_along(f_list)) {
    x <- f_list[[i]](x)
    FUN(x)
  }
  invisible(x)
}

和运行插入print函数的链:

stepper(my_chain, 0, print)

# [1] 1
# [1] 2
# [1] 3

或者等待用户输入:

stepper(my_chain, 0, function(x) {print(x); readline()})

恕我直言,magrittr 主要用于交互,即当我探索数据或构建新的 formula/model。

在这种情况下,将中间结果存储在不同的变量中非常耗时且分散注意力,而管道让我专注于数据,而不是输入:

x %>% foo
## reason on results and 
x %>% foo %>% bar
## reason on results and 
x %>% foo %>% bar %>% baz
## etc.

这里的问题是我事先不知道最终的管道是什么,就像@bergant 一样。

打字,如@zx8754,

x %>% print %>% foo %>% print %>% bar %>% print %>% baz

增加了很多开销,对我来说,破坏了 magrittr 的全部目的。

本质上 magrittr 缺少一个简单的运算符,printspipes 结果。
好消息是制作一个似乎很容易:

`%P>%`=function(lhs, rhs){ print(lhs); lhs %>% rhs }

现在您可以打印管道了:

1:4 %P>% sqrt %P>% sum 
## [1] 1 2 3 4
## [1] 1.000000 1.414214 1.732051 2.000000
## [1] 6.146264

我发现如果一个 defines/uses %P>%%>% 的键绑定,原型制作工作流程非常精简(参见 Emacs ESS or RStudio)。

您可以 select 使用发球运算符 (%T>%) 和 print() 打印哪些结果。 tee-operator 专门用于打印等副作用。

# i.e.
mtcars %>%
  group_by(cyl) %T>% print() %>%
  sample_frac(0.1) %T>% print() %>%
  summarise(res = mean(mpg))

我编写了包 pipes,它可以做几件可能有帮助的事情:

  • 使用 %P>%print 输出。
  • 使用 %ae>% 在输入和输出上使用 all.equal
  • 使用 %V>% 在输出上使用 View,它将为每个相关步骤打开一个查看器。

如果您想查看一些汇总信息,您可以尝试 %summary>%%glimpse>%%skim>%,这将使用 summarytibble::glimpseskimr::skim,或者您可以使用 new_pipe

定义自己的管道以显示特定的更改
# devtools::install_github("moodymudskipper/pipes")
library(dplyr)
library(pipes)
res <- mtcars %P>% 
  group_by(cyl) %P>% 
  sample_frac(0.1) %P>% 
  summarise(res = mean(mpg))
#> group_by(., cyl)
#> # A tibble: 32 x 11
#> # Groups:   cyl [3]
#>      mpg   cyl  disp    hp  drat    wt  qsec    vs    am  gear  carb
#>  * <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
#>  1  21       6  160    110  3.9   2.62  16.5     0     1     4     4
#>  2  21       6  160    110  3.9   2.88  17.0     0     1     4     4
#>  3  22.8     4  108     93  3.85  2.32  18.6     1     1     4     1
#>  4  21.4     6  258    110  3.08  3.22  19.4     1     0     3     1
#>  5  18.7     8  360    175  3.15  3.44  17.0     0     0     3     2
#>  6  18.1     6  225    105  2.76  3.46  20.2     1     0     3     1
#>  7  14.3     8  360    245  3.21  3.57  15.8     0     0     3     4
#>  8  24.4     4  147.    62  3.69  3.19  20       1     0     4     2
#>  9  22.8     4  141.    95  3.92  3.15  22.9     1     0     4     2
#> 10  19.2     6  168.   123  3.92  3.44  18.3     1     0     4     4
#> # ... with 22 more rows
#> sample_frac(., 0.1)
#> # A tibble: 3 x 11
#> # Groups:   cyl [3]
#>     mpg   cyl  disp    hp  drat    wt  qsec    vs    am  gear  carb
#>   <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
#> 1  26       4  120.    91  4.43  2.14  16.7     0     1     5     2
#> 2  17.8     6  168.   123  3.92  3.44  18.9     1     0     4     4
#> 3  18.7     8  360    175  3.15  3.44  17.0     0     0     3     2
#> summarise(., res = mean(mpg))
#> # A tibble: 3 x 2
#>     cyl   res
#>   <dbl> <dbl>
#> 1     4  26  
#> 2     6  17.8
#> 3     8  18.7
res <- mtcars %ae>% 
  group_by(cyl) %ae>% 
  sample_frac(0.1) %ae>% 
  summarise(res = mean(mpg))
#> group_by(., cyl)
#> [1] "Attributes: < Names: 1 string mismatch >"                                              
#> [2] "Attributes: < Length mismatch: comparison on first 2 components >"                     
#> [3] "Attributes: < Component \"class\": Lengths (1, 4) differ (string compare on first 1) >"
#> [4] "Attributes: < Component \"class\": 1 string mismatch >"                                
#> [5] "Attributes: < Component 2: Modes: character, list >"                                   
#> [6] "Attributes: < Component 2: Lengths: 32, 2 >"                                           
#> [7] "Attributes: < Component 2: names for current but not for target >"                     
#> [8] "Attributes: < Component 2: Attributes: < target is NULL, current is list > >"          
#> [9] "Attributes: < Component 2: target is character, current is tbl_df >"
#> sample_frac(., 0.1)
#> [1] "Different number of rows"
#> summarise(., res = mean(mpg))
#> [1] "Cols in y but not x: `res`. "                                                                
#> [2] "Cols in x but not y: `qsec`, `wt`, `drat`, `hp`, `disp`, `mpg`, `carb`, `gear`, `am`, `vs`. "
res <- mtcars %V>% 
  group_by(cyl) %V>% 
  sample_frac(0.1) %V>% 
  summarise(res = mean(mpg))
# you'll have to test this one by yourself