在 3D space 中绘制 (x,y,z) 点的二维数组 (Matplotlib)

Question

我是 Python 的初学者，尤其是 Matplotlib。我有一个 22797x3 数组，由另外两个数组相乘而成，一个 22797x400 长，另一个 400x3 长。在结果数组 (22797x3) 中，每行代表一个具有 (x,y,z) 坐标的点，因此有 3 列。我如何在 3D 表面上绘制结果数组，我可以在其中看到 3D space 中分布的所有 22797 个点？此数据用于将来的 Kmeans 聚类，因此我需要将其可视化。

到目前为止我已经尝试过：

import numpy as np
from matplotlib import pyplot as plt
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D

#building the 22797x3 array: 


#loading the first array from .txt file, 22797x400 long.
array = np.loadtxt('C:\Users\Scripts/final_array.txt', usecols=range(400))  
array = np.float32(array)

#loading the second array from .txt file, 400x3 long. 
small_vh2 = np.loadtxt('C:\Users\Scripts/small_vh2.txt', usecols=range(3))  
small_vh2 = np.float32(small_vh2)

#multiplying and getting result array 22797x3 long:

Y = np.array(np.matmul(array,small_vh2))
#I've checked Y dimensions, it's 22797x3 long, working fine.

#now I must plot it in 3D:
fig = plt.figure()

ax = Axes3D(fig)
ax.scatter(Y[:, 0], Y[:, 1], Y[:, 2])

plt.show()

我不断得到如下图所示的结果：

https://i.stack.imgur.com/jRyHM.jpg

我需要的是得到22797点，而我一直得到只绘制了4点。有人知道代码有什么问题吗？

Answer 1

from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
import numpy as np
from matplotlib import pyplot as plt

# made 2 random arrays of the same size as yours
array = np.random.rand(22797, 400)
small_vh2 = np.random.rand(400,3)  
Y = np.matmul(array,small_vh2)

#now I must plot it in 3D:
fig = plt.figure()
ax = fig.add_subplot(111, projection='3d')

ax.scatter(Y[:, 0], Y[:, 1], Y[:, 2], alpha = 0.1)
ax.set_xlabel('X Label')
ax.set_ylabel('Y Label')
ax.set_zlabel('Z Label')

plt.show()

在 3D space 中绘制 (x,y,z) 点的二维数组 (Matplotlib)

Plot 2D array of (x,y,z) points in 3D space (Matplotlib)

numpy

matplotlib

mplot3d