使用 Python 从 OpenDAP 批量下载数据

Question

我正在尝试从 OpenDAP 下载多个 .nc 文件。当我手动（没有脚本）下载文件时，文件按预期工作。为了加快这个过程，我有一个批量下载数据的脚本。但是，当我使用 xarray 下载数据时，文件大了 10 倍并且文件似乎已损坏。

我的脚本如下所示：

import pandas as pd
import xarray as xr
import os
import numpy as np

dates = pd.date_range(start='2016-01-01',end='2016-01-05',freq='D')
my_url = "http://www.ifremer.fr/opendap/cerdap1/ghrsst/l4/saf/odyssea-nrt/data/"

print("  ")
print("Downloading data from OPeNDAP - sit back, relax, this will take a while...")
print("...")
print("...")

# Create a list of url's 
data_url = []
cnt = 0
for i in np.arange(1,5):
    ii = i+1

    data_url.append(my_url + str(dates[cnt].year)+"/"+ str('%03d'%+ii)+"/"\
        +str(dates[cnt+1].year)+str('%02d'%dates[cnt+1].month)+str('%02d'%dates[cnt+1].day)\
        +"-IFR-L4_GHRSST-SSTfnd-ODYSSEA-SAF_002-v2.0-fv1.0.nc?time[0:1:0],lat[0:1:1749],lon[0:1:2249],analysed_sst[0:1:0][0:1:1749][0:1:2249],analysis_error[0:1:0][0:1:1749][0:1:2249],mask[0:1:0][0:1:1749][0:1:2249],sea_ice_fraction[0:1:0][0:1:1749][0:1:2249]")

    cnt = cnt+1

url_list = data_url

# Download data from the url's
count = 0
for data in url_list:
    print('Downloading file:', str(count))
    ds = xr.open_dataset(data,autoclose=True)
    fname = 'SAFodyssea_sst'+str(dates[count+1].year)+str('%02d'%dates[count+1].month)+str('%02d'%dates[count+1].day)+'.nc'
    ds.to_netcdf(fname)
    count = count +1
    del ds, fname

print('DONE !!!')

我有 xarray 版本 0.10.8。我已经使用 python 2.7 和 python 3.5.6 以及 windows 10 和 Ubuntu 16.04 尝试了运行这个，我得到了相同的结果。

非常感谢您的帮助。

Answer 1

这些文件中的每一个都作为 netCDF 文件的关联 URL，例如， http://www.ifremer.fr/opendap/cerdap1/ghrsst/l4/saf/odyssea-nrt/data/2018/001/20180101-IFR-L4_GHRSST-SSTfnd-ODYSSEA-SAF_002-v2.0-fv1.0.nc

解决此问题的一种简单方法是使用诸如请求之类的库来下载每个文件，例如，如下所述： How to download large file in python with requests.py?

使用 Python 从 OpenDAP 批量下载数据

Batch download data from OpenDAP using Python

python

opendap

python-xarray