Python 数据框中的置信区间
Confidence Interval in Python dataframe
我正在尝试计算大型数据集中 "Force" 列的均值和置信区间 (95%)。我需要使用 groupby 函数对不同的 "Classes".
进行分组来得到结果
当我计算平均值并将其放入新数据框中时,它为我提供了所有行的 NaN 值。我不确定我是否走对了路。有没有更简单的方法来做到这一点?
这是示例数据框:
df=pd.DataFrame({ 'Class': ['A1','A1','A1','A2','A3','A3'],
'Force': [50,150,100,120,140,160] },
columns=['Class', 'Force'])
要计算置信区间,我做的第一步是计算均值。这是我用的:
F1_Mean = df.groupby(['Class'])['Force'].mean()
这为我提供了所有行的 NaN
个值。
如评论中所述,我无法重现您的错误,但您可以尝试检查您的数字是否存储为数字而不是字符串。使用 df.info()
并确保相关列是 float 或 int:
<class 'pandas.core.frame.DataFrame'>
RangeIndex: 6 entries, 0 to 5
Data columns (total 2 columns):
Class 6 non-null object # <--- non-number column
Force 6 non-null int64 # <--- number (int) column
dtypes: int64(1), object(1)
memory usage: 176.0+ bytes
2021 年 10 月 25 日更新:@a-donda 指出,95% 应基于平均值的 1.96 X 标准差。
import pandas as pd
import numpy as np
import math
df=pd.DataFrame({'Class': ['A1','A1','A1','A2','A3','A3'],
'Force': [50,150,100,120,140,160] },
columns=['Class', 'Force'])
print(df)
print('-'*30)
stats = df.groupby(['Class'])['Force'].agg(['mean', 'count', 'std'])
print(stats)
print('-'*30)
ci95_hi = []
ci95_lo = []
for i in stats.index:
m, c, s = stats.loc[i]
ci95_hi.append(m + 1.96*s/math.sqrt(c))
ci95_lo.append(m - 1.96*s/math.sqrt(c))
stats['ci95_hi'] = ci95_hi
stats['ci95_lo'] = ci95_lo
print(stats)
输出为
Class Force
0 A1 50
1 A1 150
2 A1 100
3 A2 120
4 A3 140
5 A3 160
------------------------------
mean count std
Class
A1 100 3 50.000000
A2 120 1 NaN
A3 150 2 14.142136
------------------------------
mean count std ci95_hi ci95_lo
Class
A1 100 3 50.000000 156.580326 43.419674
A2 120 1 NaN NaN NaN
A3 150 2 14.142136 169.600000 130.400000
您可以利用 'sem' 来简化@yoonghm 解决方案,这是均值的标准误差。
import pandas as pd
import numpy as np
import math
df=pd.DataFrame({'Class': ['A1','A1','A1','A2','A3','A3'],
'Force': [50,150,100,120,140,160] },
columns=['Class', 'Force'])
print(df)
print('-'*30)
stats = df.groupby(['Class'])['Force'].agg(['mean', 'sem'])
print(stats)
print('-'*30)
stats['ci95_hi'] = stats['mean'] + 1.96* stats['sem']
stats['ci95_lo'] = stats['mean'] - 1.96* stats['sem']
print(stats)
我正在尝试计算大型数据集中 "Force" 列的均值和置信区间 (95%)。我需要使用 groupby 函数对不同的 "Classes".
进行分组来得到结果当我计算平均值并将其放入新数据框中时,它为我提供了所有行的 NaN 值。我不确定我是否走对了路。有没有更简单的方法来做到这一点?
这是示例数据框:
df=pd.DataFrame({ 'Class': ['A1','A1','A1','A2','A3','A3'],
'Force': [50,150,100,120,140,160] },
columns=['Class', 'Force'])
要计算置信区间,我做的第一步是计算均值。这是我用的:
F1_Mean = df.groupby(['Class'])['Force'].mean()
这为我提供了所有行的 NaN
个值。
如评论中所述,我无法重现您的错误,但您可以尝试检查您的数字是否存储为数字而不是字符串。使用 df.info()
并确保相关列是 float 或 int:
<class 'pandas.core.frame.DataFrame'>
RangeIndex: 6 entries, 0 to 5
Data columns (total 2 columns):
Class 6 non-null object # <--- non-number column
Force 6 non-null int64 # <--- number (int) column
dtypes: int64(1), object(1)
memory usage: 176.0+ bytes
2021 年 10 月 25 日更新:@a-donda 指出,95% 应基于平均值的 1.96 X 标准差。
import pandas as pd
import numpy as np
import math
df=pd.DataFrame({'Class': ['A1','A1','A1','A2','A3','A3'],
'Force': [50,150,100,120,140,160] },
columns=['Class', 'Force'])
print(df)
print('-'*30)
stats = df.groupby(['Class'])['Force'].agg(['mean', 'count', 'std'])
print(stats)
print('-'*30)
ci95_hi = []
ci95_lo = []
for i in stats.index:
m, c, s = stats.loc[i]
ci95_hi.append(m + 1.96*s/math.sqrt(c))
ci95_lo.append(m - 1.96*s/math.sqrt(c))
stats['ci95_hi'] = ci95_hi
stats['ci95_lo'] = ci95_lo
print(stats)
输出为
Class Force
0 A1 50
1 A1 150
2 A1 100
3 A2 120
4 A3 140
5 A3 160
------------------------------
mean count std
Class
A1 100 3 50.000000
A2 120 1 NaN
A3 150 2 14.142136
------------------------------
mean count std ci95_hi ci95_lo
Class
A1 100 3 50.000000 156.580326 43.419674
A2 120 1 NaN NaN NaN
A3 150 2 14.142136 169.600000 130.400000
您可以利用 'sem' 来简化@yoonghm 解决方案,这是均值的标准误差。
import pandas as pd
import numpy as np
import math
df=pd.DataFrame({'Class': ['A1','A1','A1','A2','A3','A3'],
'Force': [50,150,100,120,140,160] },
columns=['Class', 'Force'])
print(df)
print('-'*30)
stats = df.groupby(['Class'])['Force'].agg(['mean', 'sem'])
print(stats)
print('-'*30)
stats['ci95_hi'] = stats['mean'] + 1.96* stats['sem']
stats['ci95_lo'] = stats['mean'] - 1.96* stats['sem']
print(stats)