在 python 中调用 CCF 函数

Question

我正在尝试使用 python 调用 r 中使用的 ccf 函数。

from rpy2.robjects.packages import SignatureTranslatedAnonymousPackage

string = """
cc <- function(x,y) {
ccf(x,y)
}
"""

powerpack = SignatureTranslatedAnonymousPackage(string, "powerpack")

通话中：

import rpy2.robjects as ro

x = [1,2,3,4,5,5]
y = [5,6,7,8,8,9]

x = ro.Vector(tuple(x))
y = ro.Vector(tuple(y))

print (powerpack.cc(x,y))

错误：

RRuntimeError: Error in x[, (1 + cs[i]):cs[i + 1]] <- xx : 
incorrect number of subscripts on matrix

任何有关如何纠正此问题的建议都很好。

Answer 1

试试这个：

from rpy2.robjects.packages import SignatureTranslatedAnonymousPackage
import rpy2.robjects as ro


string = """
cc <- function(x,y) {
xx <- unlist(x, recursive=FALSE)
yy <- unlist(y, recursive=FALSE)
ccf(xx, yy)
}
"""

powerpack = SignatureTranslatedAnonymousPackage(string, "powerpack")

x = [1,2,3,4,5,5]
y = [5,6,7,8,8,9]

x = ro.Vector(x)
y = ro.Vector(y)

print (powerpack.cc(x,y))

解释：

首先，如果您这样做 ro.Vector(tuple(x))，您将得到一个不同的错误。

NotImplementedError: Conversion 'py2ri' not defined for objects of type ''

至少我的 python (3.7.0) 版本是这样。所以这可能不是你想要的。

如果把这两个变量从列表做成Vector再交给R，其实就是列表的列表（每个元素都是自己的1元列表）。所以你需要unlist()才能申请ccf()。请注意，在这种情况下，您实际上确实收到了报告的错误。

在 python 中调用 CCF 函数

calling CCF function in python

python

rpy2