设置环境模块

Question

我最近在 Linux Mint 19 上安装了 environment-modules 软件包（版本 4.1.1-1），我正在尝试了解如何设置不同的环境。不幸的是，docs 只给出了很少的指示，说明当您还不是该主题的专家时该怎么做（我希望有一个简单的例子，但我发现大部分只是一个命令列表）。更具体地说，我有以下情况：

我在 /usr/share/modules/ 中安装了模块。
我使用两种不同的编译器（GNU 和 Intel）编译了 OpenMPI。对应的二进制文件、库等分别位于/usr/local/modules/mpi/gnu和/usr/local/modules/mpi/intel
我想设置两个环境，一个用于 MPI 的每个编译版本，这样我就可以轻松地在它们之间切换（module load mpi/gnu、module load mpi/intel 或类似的东西）。

如果这个问题很琐碎，或者之前有人提出过，我深表歉意。仅模块包的名称就很难在网上搜索支持（就像有人将他们的产品命名为 Software；祝你在 Google 上找到你需要的东西好运）。非常感谢您的协助。

Answer 1

安装软件后，您需要编写模块文件来启用它们。首先定义放置这些模块文件的位置，例如：

mkdir /usr/local/modules/modulefiles

在此目录中，创建代表您将模块文件引用到的名称的子目录

mkdir -p /usr/local/modules/modulefiles/mpi/gnu
mkdir -p /usr/local/modules/modulefiles/mpi/intel

在这些目录中，创建一个以您所安装软件的版本号命名的模块文件（在您的例子中为 3.1.3）。使用版本号命名模块文件有助于拥有多个模块文件，以防您以后要安装更新版本的软件。

现在，创建由 /usr/local/modules/modulefiles/mpi/gnu/3.1.3 文件表示的模块文件 mpi/gnu/3.1.3 的内容 modulefile syntax:

#%Module
conflict     mpi
prepend-path PATH /usr/local/modules/mpi/gnu/bin
prepend-path LD_LIBRARY_PATH /usr/local/modules/mpi/gnu/lib
prepend-path MANPATH /usr/local/modules/mpi/gnu/man

根据您need/you想要设置的环境配置调整此内容。

对 /usr/local/modules/modulefiles/mpi/intel/3.1.3 中的 mpi/intel/3.1.3 模块文件重复此步骤。

准备好这些模块文件后，需要将它们放在 shell 会话中。这可以通过 module use 命令完成：

module use /usr/local/modules/modulefiles

从那里，可以在模块目录 (module avail) 中找到 2 个模块文件并加载 (module load)。

设置环境模块

Setting-up Environment Modules

environment-modules