dplyr

Question

我正在尝试将 IDW（反距离加权）应用于数据库中的不同组。我正在尝试使用 dplyr 将此功能应用于每个组，但我在 Split-Apply-Combine 中犯了一个错误。当前函数 return 为每组 10 个观察值提供 10 个值，但目前 dplyr 尝试在每个变异单元格中插入 10 return 个值，而不是为变异单元格插入一个新值。

问题可能与函数无关，但不幸的是我找不到更简单的函数来展示相同的错误。

我收到数据框已损坏的错误消息，新列中填充了值。

   group N      Lat     Long Obs   idw_val
1      A 1 49.43952 20.42646  11 <dbl[10]>
2      B 1 49.76982 19.70493   8 <dbl[10]>

该示例有望阐明这一点。解决方案可能非常简单 - 非常感谢一些对我有帮助的指示...

require(ggmap)
require(dplyr)
require(raster)
require(sp)
require(gstat)
require(lattice)

####create dataset
set.seed(123)
dh = expand.grid(group = c("A","B","C"),
                 N=1:10)

dh$Lat=rnorm(nrow(dh),50,1)
dh$Long=rnorm(nrow(dh),20,1)
dh$Obs=rpois(nrow(dh),10)
dh

#####create grid
pixels <- 10

#####function defintion 
idw_w=function(x,y,z){

  geog2 <- data.frame(x,y,z)
  coordinates(geog2) = ~x+y

  geog.grd <- expand.grid(x=seq(floor(min(coordinates(geog2)[,1])),
                                ceiling(max(coordinates(geog2)[,1])),
                                length.out=pixels),
                          y=seq(floor(min(coordinates(geog2)[,2])),
                                ceiling(max(coordinates(geog2)[,2])),
                                length.out=pixels))

# Assigning coordinates results in spdataframe.
  grd.pts <- SpatialPixels(SpatialPoints((geog.grd)))
  grd <- as(grd.pts, "SpatialGrid")

##### IDW interpolation.
  geog2.idw <- idw(z ~ 1, geog2, grd, idp=4)

####overlay
  pts <- SpatialPoints(cbind(x, y))
  over(pts, geog2.idw["var1.pred"])
}

#### test function
idw_w(dh$Lat,dh$Long,dh$Obs)

####groupwise dplyr
dh2 = dh %>%
  #   arrange(Block, Species, Date) %>%
  group_by(group) %>%
  mutate(idw_val=idw_w(x=Lat,y=Long,z=Obs)) 

dh2
str(dh2)

Answer 1

如果我理解你想要的是正确的，那么只需确保你的函数 returns 是一个值向量而不是 data.frame 对象。我认为当运行通过 mutate() 步骤时，此函数将执行您想要的操作：

idw_w=function(x,y,z){

  geog2 <- data.frame(x,y,z)
  coordinates(geog2) = ~x+y

  geog.grd <- expand.grid(x=seq(floor(min(coordinates(geog2)[,1])),
                                ceiling(max(coordinates(geog2)[,1])),
                                length.out=pixels),
                          y=seq(floor(min(coordinates(geog2)[,2])),
                                ceiling(max(coordinates(geog2)[,2])),
                                length.out=pixels))

# Assigning coordinates results in spdataframe.
  grd.pts <- SpatialPixels(SpatialPoints((geog.grd)))
  grd <- as(grd.pts, "SpatialGrid")

##### IDW interpolation.
  geog2.idw <- idw(z ~ 1, geog2, grd, idp=4)

####overlay
  pts <- SpatialPoints(cbind(x, y))
  (over(pts, geog2.idw["var1.pred"]))[,1]
}

dplyr - 应用函数后的错误信息

dplyr - error message after applying function

r

apply

spatial