使用 dplyr 在时间序列数据中用 NA 替换重复值

Question

我的数据似乎与其他类似帖子有点不同。

box_num      date       x        y
1-Q      2018-11-18   20.2      8
1-Q      2018-11-25   21.23     7.2
1-Q      2018-12-2    21.23     23
98-L     2018-11-25   0.134     9.3
98-L     2018-12-2    0.134     4
76-GI    2018-12-2    22.734    4.562
76-GI    2018-12-9    28        4.562

这里我想用 NA 替换 x 和 y 列中的重复值。我尝试使用 dplyr 的代码：

(1)df <- df %>% group_by(box_num) %>% arrange(box_num,date) %>%
  mutate(df$x[duplicated(df$x),] <- NA)

它创建一个包含所有 NA 的新列，而不是仅仅用 NA 替换重复值

 (2)df <- df %>% group_by(box_num) %>% arrange(box_num,date) %>%  
distinct(x,.keep_all = TRUE)

第二个只给出不重复的行（我们缺少时间序列）期望的输出：

box_num      date       x        y
    1-Q      2018-11-18   20.2      8
    1-Q      2018-11-25   21.23     7.2
    1-Q      2018-12-2    NA        23
    98-L     2018-11-25   0.134     9.3
    98-L     2018-12-2    NA        4
    76-GI    2018-12-2    22.734    4.562
    76-GI    2018-12-9    28        NA

Answer 1

使用 dplyr 我们可以 group_by box_num 并使用 mutate_at x 和 y 列并替换 duplicated价值 NA.

library(dplyr)

df %>%
  group_by(box_num) %>%
  mutate_at(vars(x:y), funs(replace(., duplicated(.), NA)))


# box_num date          x     y
#  <fct>   <fct>      <dbl> <dbl>
#1 1-Q     2018-11-18 20.2    8   
#2 1-Q     2018-11-25 21.2    7.2 
#3 1-Q     2018-12-2  NA     23   
#4 98-L    2018-11-25  0.134  9.3 
#5 98-L    2018-12-2  NA      4   
#6 76-GI   2018-12-2  22.7    4.56
#7 76-GI   2018-12-9  28     NA

基本的 R 选项（在这种情况下可能不是最好的）是：

cols <- c("x", "y")
df[cols] <- sapply(df[cols], function(x) 
            ave(x, df$box_num, FUN = function(x) replace(x, duplicated(x), NA)))

Answer 2

这里有一个 data.table 的选项。将'data.frame'转换为'data.table'（setDT(df1)，在.SDcols中指定感兴趣的列，replace列中的重复元素与NA和通过将 (:=) 输出分配回列

来更新这些列

library(data.table)
setDT(df1)[,  c('x', 'y') := lapply(.SD, function(x) 
     replace(x, anyDuplicated(x), NA)), box_num, .SDcols= x:y]
df1
#   box_num       date      x      y
#1:     1-Q 2018-11-18 20.200  8.000
#2:     1-Q 2018-11-25 21.230  7.200
#3:     1-Q  2018-12-2     NA 23.000
#4:    98-L 2018-11-25  0.134  9.300
#5:    98-L  2018-12-2     NA  4.000
#6:   76-GI  2018-12-2 22.734  4.562
#7:   76-GI  2018-12-9 28.000     NA

数据

df1 <- structure(list(box_num = c("1-Q", "1-Q", "1-Q", "98-L", "98-L", 
 "76-GI", "76-GI"), date = c("2018-11-18", "2018-11-25", "2018-12-2", 
"2018-11-25", "2018-12-2", "2018-12-2", "2018-12-9"), x = c(20.2, 
 21.23, 20.2, 0.134, 0.134, 22.734, 28), y = c(8, 7.2, 23, 9.3, 
 4, 4.562, 4.562)), class = "data.frame", 
 row.names = c(NA, -7L))

使用 dplyr 在时间序列数据中用 NA 替换重复值

replace duplicate values with NA in time series data using dplyr

r

time-series

duplicates

na

dplyr

数据