从网络文件导入边方向

Import edge direction from networkfile

我有一个使用我开发的工具创建的网络文件,网络文件看起来像这样

GeneA     GeneB     <-
GeneB     GeneC     ->
GeneD     GeneC     ->
GeneD     GeneF     <-

导入网络本身已成功完成,但我正在寻找一种在网络中导入路线的方法。由于方向并不总是相同,有人能告诉我如何将这些方向导入 cytoscape 中吗?找了很多都没找到解决办法

在 Cytoscape.js 中,您可以将箭头指向四个不同的位置(有关详细信息,请参阅 documentation)。

有向图的标准是边缘末端指向 target 节点的箭头。这可以通过将 target-arrow-shape 设置为支持的形状(例如 triangleteevee 等)来实现。您还需要正确设置每条边的 sourcetarget。在你的例子中

GeneA     GeneB     <-

GeneB 是源,GeneA 是目标,

GeneB     GeneC     ->

GeneB 是源,GeneC 是目标,依此类推。

对于不同的箭头类型,请参阅 this example