根据 hcharter 中的给定序列设置热图颜色范围

Question

我在这里尝试使用 highcharter::hcharter() 创建热图，其中 小于 -1 应该是一种颜色（粉红色），-1 to 1应该是透明或者白色，而大于+1应该是另一种颜色（紫色）。

目前我已经使用hchart()编写代码并使用color_stops更改颜色格式。但是当数据以 0 为中心时这非常有效，但是当它不以 0 为中心时让我们说从 -5 到 +7.5 white/transparent 颜色将转移到 1如下图所示。

a1 <- rnorm(30,0,2)  
a2 <- rnorm(30,0,2)  
a3 <- rnorm(30,0,2)  
a4 <- rnorm(30,0,2)  
a <- cbind(a1,a2,a3,a4)
heatmap_matrix <- as.matrix(a)

library(highcharter) 
hchart(heatmap_matrix) %>%  
  hc_colorAxis(stops = color_stops(n = 3, colors = c("#FF1493", "white", "#800080")))

对于 -5 to +7.5
之间的数据范围 -5 到 -1 应该显示粉色渐变颜色
-1 到 +1 应该显示白色
+1 到 7.5 应该显示紫色渐变颜色

Answer 1

hc_colorAxis() 中的参数 stops 需要一个列表，该列表将最小值定义为 0，将最大值定义为 1。可以设置一个0~1之间的数字来表示某个值的位置，并设置它的颜色。

找到零所在的位置

$position(x)=\frac{x-min}{max-min}$

p <- (0 - min(heatmap_matrix)) / (max(heatmap_matrix) - min(heatmap_matrix))

设置自定义列表

stops <- data.frame(q = c(0, p, 1),
                    c = c("#FF1493", "#FFFFFF", "#800080"),
                    stringsAsFactors = FALSE)
#          q       c
# 1 0.000000 #FF1493
# 2 0.434873 #FFFFFF
# 3 1.000000 #800080

stops <- list_parse2(stops)

控制参数

hchart(heatmap_matrix) %>%  
  hc_colorAxis(stops = stops, startOnTick = F, endOnTick = F)

根据 hcharter 中的给定序列设置热图颜色范围

Setting Heat Map Color range as per given Sequence in hcharter

r

heatmap

r-highcharter