OpenMPI：SGE 集群上的主机密钥验证失败
OpenMPI: Host key verification failed on SGE cluster
我最近在我的 SGE 集群上安装了 OpenMPI 2.0 版。但是当我提交一份工作时，我得到 "Host ket verification failed"。即使我能够在没有提交主机的密码的情况下登录到该节点（compute10）。
输出文件中的错误：
Warning: no access to tty (Bad file descriptor). Thus no job control
in this shell. Wed Jan 30 15:58:53 EST 2019 Host key verification
failed. [file orca_main/gtoint.cpp, line 137]: ORCA finished by error
termination in ORCA_GTOInt
我的 SGE 脚本如下：
!/bin/tcsh
$ -q sge-queue@compute10
$ -pe mpi 8
$ -V
$ -cwd
$ -j y
$ -l h_vmem=64G
date
setenv OMP_NUM_THREADS 8
/home/user/orca_4_0_1_2_linux_x86-64_openmpi202/orca ccl3.inp >
ccl3.out
date
和我的并行环境mpi:
pe_name mpi
slots 999
user_lists NONE
xuser_lists NONE
start_proc_args /export/sge6.2_U7/mpi/startmpi.sh -catch_rsh
$pe_hostfile
stop_proc_args /export/sge6.2_U7/mpi/stopmpi.sh
allocation_rule $pe_slots
control_slaves TRUE
job_is_first_task FALSE
urgency_slots min
accounting_summary TRUE
尝试各种方法后，将 OpenMPI 更新到 3.1.0 版本并使用以下选项构建解决了问题。
./configure --prefix=/usr/local --with-sge
--enable-orterun-prefix-by-default
我最近在我的 SGE 集群上安装了 OpenMPI 2.0 版。但是当我提交一份工作时，我得到 "Host ket verification failed"。即使我能够在没有提交主机的密码的情况下登录到该节点（compute10）。
输出文件中的错误：
Warning: no access to tty (Bad file descriptor). Thus no job control in this shell. Wed Jan 30 15:58:53 EST 2019 Host key verification failed. [file orca_main/gtoint.cpp, line 137]: ORCA finished by error termination in ORCA_GTOInt
我的 SGE 脚本如下：
!/bin/tcsh
$ -q sge-queue@compute10
$ -pe mpi 8
$ -V
$ -cwd
$ -j y
$ -l h_vmem=64G
date
setenv OMP_NUM_THREADS 8
/home/user/orca_4_0_1_2_linux_x86-64_openmpi202/orca ccl3.inp > ccl3.out
date
和我的并行环境mpi:
pe_name mpi
slots 999
user_lists NONE
xuser_lists NONE
start_proc_args /export/sge6.2_U7/mpi/startmpi.sh -catch_rsh $pe_hostfile
stop_proc_args /export/sge6.2_U7/mpi/stopmpi.sh
allocation_rule $pe_slots
control_slaves TRUE
job_is_first_task FALSE
urgency_slots min
accounting_summary TRUE
尝试各种方法后，将 OpenMPI 更新到 3.1.0 版本并使用以下选项构建解决了问题。
./configure --prefix=/usr/local --with-sge --enable-orterun-prefix-by-default