将 2d NumPy 数组重塑为具有重复行的 3d

Reshaping 2d NumPy array into 3d with recurring rows

我有一个 NumPy 数组如下:

arr = np.array([[1,2,3,4,5],[6,7,8,9,10],[11,12,13,14,15],[16,17,18,19,20]])

我正在寻找这样的安排:

[[[6,7,8,9,10],
  [1,2,3,4,5]],
 [[11,12,13,14,15],
  [6,7,8,9,10]],
 [[16,17,18,19,20],
  [11,12,13,14,15]]]

所以本质上是一个 3D 数组,数组的每一行都有 2x5。 我试过的代码是:

x=np.zeros([3,2,5])
for i in range(len(arr)):
    x[i]=arr[i:i+2,:][::-1]

但这会导致以下输出:

[[[ 6.  7.  8.  9. 10.]
  [ 1.  2.  3.  4.  5.]]    
 [[ 0.  0.  0.  0.  0.]
  [ 0.  0.  0.  0.  0.]]  
 [[ 0.  0.  0.  0.  0.]
  [ 0.  0.  0.  0.  0.]]]

[[[ 6.  7.  8.  9. 10.]
  [ 1.  2.  3.  4.  5.]]    
 [[11. 12. 13. 14. 15.]
  [ 6.  7.  8.  9. 10.]]    
 [[ 0.  0.  0.  0.  0.]
  [ 0.  0.  0.  0.  0.]]]

[[[ 6.  7.  8.  9. 10.]
  [ 1.  2.  3.  4.  5.]]    
 [[11. 12. 13. 14. 15.]
  [ 6.  7.  8.  9. 10.]]    
 [[16. 17. 18. 19. 20.]
  [11. 12. 13. 14. 15.]]]

无需使用任何循环。切片就够了:

x = np.zeros([3,2,5], dtype=int)
x[:,0] = arr[-3:,:]
x[:,1] = arr[:3,:]

基本上,您将所有页面中的第 0 行分配给 arr 的最后 3 行,并将所有页面中的第 1 行分配给 arr 的前 3 行。[=13] =]

您可以使用一些 stride tricks 将数组构造为在输入数组上滑动 window 的多维数组:

import numpy as np 
arr = np.array([[1,2,3,4,5],[6,7,8,9,10],[11,12,13,14,15],[16,17,18,19,20]]) 

# compute the strides and shape of the output array
in_strides = arr.strides 
out_strides = in_strides[:1] + in_strides 
out_shape = (3, 2) + arr.shape[-1:]  # keep the last dimension's size
strided = np.lib.stride_tricks.as_strided(arr, strides=out_strides, shape=out_shape)
out_arr = strided[:, ::-1, :].copy()  # use a copy to stay safe

只要 out_shape[-1] <= arr.shape[1]sum(out_shape[:2]) <= arr.shape[0] + 1 以上内容就可以安全运行。这些是使滑动 window 在原始数组中有意义的约束,您的实际用例自然应该遵守这些约束。

重要提示:

  • 如果上述不等式不成立,那么滑动 window 将愉快地滑出数组的内存范围,您将静静地开始看到垃圾矩阵元素:

    >>> out_strides = in_strides[:1] + in_strides 
    ... out_shape = (3, 3, 5)  # 3 + 3 == 6 > arr.shape[0] + 1 == 5
    ... np.lib.stride_tricks.as_strided(arr, strides=out_strides, shape=out_shape)
    array([[[         1,              2,              3,              4,
                      5],
        [             6,              7,              8,              9,
                     10],
        [            11,             12,             13,             14,
                     15]],
    
       [[             6,              7,              8,              9,
                     10],
        [            11,             12,             13,             14,
                     15],
        [            16,             17,             18,             19,
                     20]],
    
       [[            11,             12,             13,             14,
                     15],
        [            16,             17,             18,             19,
                     20],
        [           384,            193, 94379169559968,              0,
                      0]]])
    
  • 如果你之后不会改变你的数组,并且只有这样,你可以省略上面最后的 .copy() 调用。这将为您提供一个与原始数组共享内存的跨步数组,但更重要的是,数组的行将彼此共享内存。这 不是 您通常想要的,但是如果您的实际数组非常大 and 您知道您可以安全地假设这些值不会独立变异,内存占用可能很重要。另一个需要考虑的方面是,对结果调用 .copy() 会给你一个连续的内存块,这可能对性能更好,具体取决于你打算对结果数组做什么。

我们可以利用 np.lib.stride_tricks.as_strided based scikit-image's view_as_windows to get sliding windows. .

from skimage.util.shape import view_as_windows

x = view_as_windows(arr,(2,arr.shape[1]))[:,0,::-1]

这只是输入数组的一个视图。因此,没有额外的内存开销和几乎免费的 运行 时间。如果你想要一个带有自己内存 space 的输出,请在此处附加 .copy(),即 x.copy().

样本运行-

In [15]: from skimage.util.shape import view_as_windows

In [16]: view_as_windows(arr,(2,arr.shape[1]))[:,0,::-1]
Out[16]: 
array([[[ 6,  7,  8,  9, 10],
        [ 1,  2,  3,  4,  5]],

       [[11, 12, 13, 14, 15],
        [ 6,  7,  8,  9, 10]],

       [[16, 17, 18, 19, 20],
        [11, 12, 13, 14, 15]]])