R函数创建和保存图形

Question

我正在尝试创建并保存多个图形。我被困在 factoextra 包用于制作图表的情况下。

  pca.plot<-function(x){
  biplot<-paste(out_f,"\biplot.jpg", sep="")
  jpeg(file=biplot, type="cairo")
  fviz_pca_biplot(x,  geom = "text")
  dev.off()
}

这是一个从输入 pca 对象创建双标图的简单函数（使用 FactoMineR 包创建的 pca） out_f 是先前定义的。当我逐行运行脚本时，它起作用了。当我运行它作为脚本时，没有创建任何东西。

  pca.plot<-function(x){
  pve<-paste(out_f,"\proportion_of_variance_explained.jpg", sep="")
  jpeg(file=pve, type="cairo")
  barplot(x$eig[,2], names.arg=1:nrow(x$eig),
          main = "Variances",
          xlab = "Principal Components",
          ylab = "Percentage of variances",
          col ="steelblue")
  lines(x = 1:nrow(x$eig), x$eig[, 2], type="b", pch=19, col = "red")
  dev.off()   
}

在这种情况下是没有问题的。有谁知道第一种情况为什么会出问题？

提前致谢，约翰

Answer 1

factoextra制作的图是ggplot2。你应该使用 print(fviz_pca_biplot(res.pca)) 如下：

# Principal component analysis
data(iris)
res.pca <- prcomp(iris[, -5],  scale = TRUE)

# This will do nothing
jpeg("biplot.jpg")
fviz_pca_biplot(res.pca)
dev.off()

# This will do the right thing
jpeg("biplot.jpg")
print(fviz_pca_biplot(res.pca))
dev.off()

祝你好运！

R函数创建和保存图形

R function to create and save graphic

r

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factoextra