如何使用方法在 S4 对象 r 中设置值（无需输入值）

Question

这是一个由两部分组成的问题。我想根据不同的插槽值设置原型 s4 对象的值，或者我想将其实现为一种方法。

我有一个要创建的对象。它有一些插槽。我想根据从另一个插槽输入的值设置一个插槽值。这是我想做的事情的简化版本。

即

setClass("Person",
    representation(name = "character", age = "numeric", doubleAge = "numeric"),
    prototype(name = "Bob", age = 5, doubleAge = 10) )

现在我想创建一个对象，但要根据年龄段自行设置 doubleAge 值。

p1 <- new("Person", name = "Alice", age = 6)

明白了

An object of class "Person"                                                                                                      
Slot "name":                                                                                                                     
[1] "Alice"                                                                                                                  

Slot "age":                                                                                                                    
[1] 6                                                                                                                        

Slot "doubleAge":                                                                                                              
[1] 10

但我想看到 doubleAge 为 12。在原型中，我不知道如何将 doubleAge = 10 更改为 doubleAge = 2*age

因此，作为解决方案，我尝试创建一个设置函数 init，它在创建后设置值。这是第 2 部分的问题。

setGeneric("init", "Person", function(object) {
    standardGeneric("init")
}
setMethod("init","Person", function(object) {
    object@doubleAge <- object@age*2
    object
}

如果我在方法中打印 object@doubleAge returns 12，但似乎范围结束了，因为当它 returns

时它是 10

目前的工作原理非常相似，但并不正确。

setGeneric("init<-", "Person", function(object) {
    standardGeneric("init<-")
}
setMethod("init<-","Person", function(object) {
    object@doubleAge <- object@age*2
    object
}

但后来我不得不像 init(p1) <- NULL 那样打电话，这看起来很奇怪。我知道这个例子看起来微不足道，但它只是更复杂的现实世界问题的一个准系统示例。

Answer 1

似乎覆盖初始化方法对我有用。例如

setClass("Person",
         representation(name = "character", age = "numeric", doubleAge = "numeric"),
         prototype(name = "Bob", age = 5, doubleAge = 10) )

setMethod("initialize", "Person", function(.Object, ...) {
  .Object <- callNextMethod()
  .Object@doubleAge <- .Object@age*2
  .Object
})

(p1 <- new("Person", name = "Alice", age = 6))
# An object of class "Person"
# Slot "name":
# [1] "Alice"
# Slot "age":
# [1] 6
# Slot "doubleAge":
# [1] 12

callNextMethod() 运行 "default" 初始化程序来设置我们没有搞乱的所有值。然后我们只需更改我们想要的值和 return 更新的对象。

Answer 2

除了上述 initialize 的方法外，您可能还想为 @<- 设置一个方法。这样做的原因是如果你做类似

x <- new("person", age=5)

那么你有一个 age=5 和 doubleage=10 的有效人选。但是如果你现在做

x@age <- 6

？现在 age 是 6 但 doubleage 仍然是 10 所以对象不再有效。

R 文档声称您可以为 @<- 编写一个方法来解决此问题：

setMethod("@<-",signature(object="Person"),function(object,name,value){
  if(name=="age"){
    object@age <- x
    object@doubleAge <- x*2
  } else if(e2=="doubleAge"){
    object@doubleAge <- x
    object@age <- value/2
  } else slot(object,name) <- value
  object
})

然而，当你实际运行以上时，你会得到一个错误：

Error in setGeneric(f, where = where) : ‘@<-’ dispatches internally; methods can be defined, but the generic function is implicit, and cannot be changed.

这是一个看起来很奇怪的错误，因为我们并不是要重新定义泛型。事实上我们发现，当我们尝试

method.skeleton("@<-",signature(object="Person"))

那个R不情愿的告诉我们

Error in genericForBasic(name) : methods may not be defined for primitive function ‘@<-’ in this version of R

所以如果你想让插槽可靠地保持一致，我们将不得不按照

的方式编写自己的 getter 和 setter

setAge <- function(x,value){
  x@age <- value
  x@doubleAge <- value*2
  x
}

如何使用方法在 S4 对象 r 中设置值（无需输入值）

how to set value in S4 object r using a method (no input value needed)

r

oop

s4