使用 dplyr mutate 在 RMarkdown for pdf 中使用 extraKable 遮蔽 table？

Question

我想根据不同的值集对 table 应用不同的颜色阴影。我正在使用 kableExtra 在 Rmarkdown 中创建这个 table。我希望 0 和 <.10 之间的值保持不变。 >=.10 和 <.20 的值以黄色阴影显示。值 >=.20 为红色阴影。

  df
  name    category 1    categry 2    category a   category b
  ab          .01         .45           .19          .09
  410         .12         .01           .05          .66
  NW 5th      .25         .22           .01          .16

这就是我用以下方式制作现有 table 的内容：

 library(knitr)
 library(dplyr)

 kable(df, caption = "warning values", digits = 2, format = "latex", 
 booktabs = T)%>%
 kable_styling(latex_options = c("striped"))%>%
 landscape()%>%
 row_spec(0, angle = 45)

我不确定如何使用 mutate 和 cel_spec 函数来应用于整个 table。 table 列和行名称随每个报告动态变化。

编辑：马丁的回答很有效。直到我试图清理我的号码。我的实际输入文件有更多数字，如 Martin 的回答。它还具有包含下划线的文件名和行名。（这在使用此答案时引起了问题，但我找到了解决方法。）

 #replace any "_" with escaped "\_" for magrittR/latex compatability
 names(df) <- gsub(x = names(df), pattern = "\_", replacement = 
 "\\_") 
 df$name <- gsub('\_', '\\_', df$name)

 #format numbers
 df <- format(df, digits=0, nsmall=3, scientific = FALSE)

替换工作正常，是数字格式破坏了答案。一切仍然执行得很好，但我失去了彩色 table。想法？

Answer 1

这是执行此操作的方法。请注意，我使用了 magrittr 中的复合赋值运算符。

---
title: test
output: pdf_document
---

```{r, echo = F, warning = F, message = F}
library(knitr)
library(dplyr)
library(kableExtra)
library(magrittr)
df <- data.frame(A = runif(4, 0, 1), B = runif(4, 0, 1), row.names = letters[1:4])

paint <- function(x) {  # our painting function
  ifelse(x < 0.1, "white", ifelse(x < 0.2, "yellow", "red"))
}

df %<>%. # compound assignment operator
  mutate_if(is.numeric, function(x) {  # conditional mutation, if the column type is numeric
   cell_spec(x, background = paint(x), format = "latex") 
  })

kable(df, caption = "warning values", digits = 2, format = "latex", 
      booktabs = T, escape = F) %>%
  landscape()%>%
  row_spec(0, angle = 45)
```

使用 dplyr mutate 在 RMarkdown for pdf 中使用 extraKable 遮蔽 table？

Shade table with extraKable in RMarkdown for pdf using dplyr mutate?

r

r-markdown

dplyr

kableextra