vcf 文件在转换为 BCF 之前修改
vcf files modification before converting to BCF
我要将新的 vcf 文件添加到以前制作的 bcf 文件中，其中 VCF 中的 ID 字段已设置为 CHR:POS:POS:REF:ALT？
如何将 VCF 中的 ID 字段设置为 CHR:POS:POS:REF:ALT？
我相信您正在寻找 --set-id 选项。来自 http://www.htslib.org/doc/bcftools.html 的文档：
分配ID：
bcftools annotate --set-id +'%CHROM\_%POS\_%REF\_%FIRST_ALT' file.vcf
我要将新的 vcf 文件添加到以前制作的 bcf 文件中，其中 VCF 中的 ID 字段已设置为 CHR:POS:POS:REF:ALT？
如何将 VCF 中的 ID 字段设置为 CHR:POS:POS:REF:ALT？
我相信您正在寻找 --set-id 选项。来自 http://www.htslib.org/doc/bcftools.html 的文档：
分配ID：
bcftools annotate --set-id +'%CHROM\_%POS\_%REF\_%FIRST_ALT' file.vcf