Plotly:如何设置热图纵横比?
Plotly: How to set heatmap aspect ratio?
我有一个单通道图像,其中每个整数像素值映射到一个字符串。例如 5 -> 'person'。我正在尝试创建一个交互式图像,将鼠标悬停在像素上会显示相应的字符串。
我认为使用 plotly 热图可能是实现此目的的方法。我遇到的问题是:
- 真的很慢。如果我使我的 numpy 数组大小均匀 (100,100),加载需要几分钟。我在想这可能是因为我的代码效率不高?
- 我不知道如何保持纵横比。因此,如果我的图像是大小为 (100,100) 的 numpy 数组,我希望绘图也为 (100,100) 像素。
- 为
z_text
使用空白值似乎是一个糟糕的解决方法,但设置 annotation_text=None
似乎不起作用。
有人可以帮我吗?这是我得到的:
import numpy as np
import plotly.graph_objs as go
from plotly.offline import download_plotlyjs, init_notebook_mode, plot, iplot
init_notebook_mode(connected=True)
import plotly.figure_factory as ff
z = np.random.randint(0,6, size=(10, 10))
z_text = np.full(z.shape, '', dtype=str)
d = {0:'a', 1:'b', 2:'c', 3:'d', 4:'e', 5:'f'}
class_mat = np.vectorize(d.get)(z)
fig = ff.create_annotated_heatmap(z, annotation_text=z_text, text=class_mat, hoverinfo='text', colorscale='Viridis', )
fig.layout.title = 'Semantic Segmentation'
iplot(fig, filename='annotated_heatmap_text')
这是目前的样子:
此外,如果绘图热图不是解决此问题的最佳方式,我很乐意听到任何替代方案!
注意:我目前正在 jupyterlab 中展示。
我不确定这里的每个细节是否正确,但下面代码片段中的代码将在 Jupyter Notebook 中生成以下图表。处理宽高比的那一行是:
fig['layout']['yaxis']['scaleanchor']='x'
您还可以使用:
fig.update_layout(yaxis = dict(scaleanchor = 'x'))
情节 1:
情节 2:
只需确保包括:
fig.update_layout(plot_bgcolor='rgba(0,0,0,0)')
否则你会得到这样的结果:
代码 1 - 我对您的示例所做的编辑:
fig.data[0]['hoverinfo'] = 'all'
fig['layout']['yaxis']['scaleanchor']='x'
fig['layout']['xaxis']['gridcolor'] = 'rgba(0, 0, 0, 0)'
fig['layout']['yaxis']['gridcolor'] = 'rgba(0, 0, 0, 0)'
fig['layout']['yaxis']['color'] = 'rgba(0, 0, 0, 0)'
代码 2 - 简单复制和粘贴的全部内容:
import numpy as np
import plotly.graph_objs as go
from plotly.offline import download_plotlyjs, init_notebook_mode, plot, iplot
init_notebook_mode(connected=True)
import plotly.figure_factory as ff
#%qtconsole
z = np.random.randint(0,6, size=(10, 10))
z_text = np.full(z.shape, '', dtype=str)
d = {0:'a', 1:'b', 2:'c', 3:'d', 4:'e', 5:'f'}
class_mat = np.vectorize(d.get)(z)
fig = ff.create_annotated_heatmap(z, annotation_text=z_text,
text=class_mat, hoverinfo='text', colorscale='Viridis',
# x = list('ABCDEFGHIJ'),
# y = list('ABCDEFGHIJ')
)
fig.layout.title = 'Semantic Segmentation'
# My suggestions:
fig.data[0]['hoverinfo'] = 'all'
fig['layout']['yaxis']['scaleanchor']='x'
fig['layout']['xaxis']['gridcolor'] = 'rgba(0, 0, 0, 0)'
fig['layout']['yaxis']['gridcolor'] = 'rgba(0, 0, 0, 0)'
fig['layout']['yaxis']['color'] = 'rgba(0, 0, 0, 0)'
fig.update_layout(plot_bgcolor='rgba(0,0,0,0)')
fig.show()
速度:
即使是这个小图也需要一些时间来绘制,但到目前为止我没有任何关于如何加快速度的建议。
很老了,但对于其他关注热图性能问题(特别是带注释的热图替代方案)的人来说,这些可能是相关的:
此外,如果您使用 plotly.express.imshow
绘制热图,则该函数 aspect='auto'
有一个参数,它将更新纵横比以填充绘图具有的 space .
例如:
import plotly.express as px
# fill/load df accordingly to your needs
fig = px.imshow(df, aspect='auto')
我有一个单通道图像,其中每个整数像素值映射到一个字符串。例如 5 -> 'person'。我正在尝试创建一个交互式图像,将鼠标悬停在像素上会显示相应的字符串。
我认为使用 plotly 热图可能是实现此目的的方法。我遇到的问题是:
- 真的很慢。如果我使我的 numpy 数组大小均匀 (100,100),加载需要几分钟。我在想这可能是因为我的代码效率不高?
- 我不知道如何保持纵横比。因此,如果我的图像是大小为 (100,100) 的 numpy 数组,我希望绘图也为 (100,100) 像素。
- 为
z_text
使用空白值似乎是一个糟糕的解决方法,但设置annotation_text=None
似乎不起作用。
有人可以帮我吗?这是我得到的:
import numpy as np
import plotly.graph_objs as go
from plotly.offline import download_plotlyjs, init_notebook_mode, plot, iplot
init_notebook_mode(connected=True)
import plotly.figure_factory as ff
z = np.random.randint(0,6, size=(10, 10))
z_text = np.full(z.shape, '', dtype=str)
d = {0:'a', 1:'b', 2:'c', 3:'d', 4:'e', 5:'f'}
class_mat = np.vectorize(d.get)(z)
fig = ff.create_annotated_heatmap(z, annotation_text=z_text, text=class_mat, hoverinfo='text', colorscale='Viridis', )
fig.layout.title = 'Semantic Segmentation'
iplot(fig, filename='annotated_heatmap_text')
这是目前的样子:
此外,如果绘图热图不是解决此问题的最佳方式,我很乐意听到任何替代方案!
注意:我目前正在 jupyterlab 中展示。
我不确定这里的每个细节是否正确,但下面代码片段中的代码将在 Jupyter Notebook 中生成以下图表。处理宽高比的那一行是:
fig['layout']['yaxis']['scaleanchor']='x'
您还可以使用:
fig.update_layout(yaxis = dict(scaleanchor = 'x'))
情节 1:
情节 2:
只需确保包括:
fig.update_layout(plot_bgcolor='rgba(0,0,0,0)')
否则你会得到这样的结果:
代码 1 - 我对您的示例所做的编辑:
fig.data[0]['hoverinfo'] = 'all'
fig['layout']['yaxis']['scaleanchor']='x'
fig['layout']['xaxis']['gridcolor'] = 'rgba(0, 0, 0, 0)'
fig['layout']['yaxis']['gridcolor'] = 'rgba(0, 0, 0, 0)'
fig['layout']['yaxis']['color'] = 'rgba(0, 0, 0, 0)'
代码 2 - 简单复制和粘贴的全部内容:
import numpy as np
import plotly.graph_objs as go
from plotly.offline import download_plotlyjs, init_notebook_mode, plot, iplot
init_notebook_mode(connected=True)
import plotly.figure_factory as ff
#%qtconsole
z = np.random.randint(0,6, size=(10, 10))
z_text = np.full(z.shape, '', dtype=str)
d = {0:'a', 1:'b', 2:'c', 3:'d', 4:'e', 5:'f'}
class_mat = np.vectorize(d.get)(z)
fig = ff.create_annotated_heatmap(z, annotation_text=z_text,
text=class_mat, hoverinfo='text', colorscale='Viridis',
# x = list('ABCDEFGHIJ'),
# y = list('ABCDEFGHIJ')
)
fig.layout.title = 'Semantic Segmentation'
# My suggestions:
fig.data[0]['hoverinfo'] = 'all'
fig['layout']['yaxis']['scaleanchor']='x'
fig['layout']['xaxis']['gridcolor'] = 'rgba(0, 0, 0, 0)'
fig['layout']['yaxis']['gridcolor'] = 'rgba(0, 0, 0, 0)'
fig['layout']['yaxis']['color'] = 'rgba(0, 0, 0, 0)'
fig.update_layout(plot_bgcolor='rgba(0,0,0,0)')
fig.show()
速度:
即使是这个小图也需要一些时间来绘制,但到目前为止我没有任何关于如何加快速度的建议。
很老了,但对于其他关注热图性能问题(特别是带注释的热图替代方案)的人来说,这些可能是相关的:
此外,如果您使用 plotly.express.imshow
绘制热图,则该函数 aspect='auto'
有一个参数,它将更新纵横比以填充绘图具有的 space .
例如:
import plotly.express as px
# fill/load df accordingly to your needs
fig = px.imshow(df, aspect='auto')