MPI-Parallel HDF5：H5Pset_fapl_mpio 等同于 C++

Question

我想在分布式内存集群上使用并行 HDF5 作为我的 MPI 应用程序的输出。我熟悉 C 接口，但也想尝试 C++ API。

然而，当我试图 "convert" 这个命令 H5Pset_fapl_mpio( p_list, MPI_COMM_WORLD, MPI_INFO_NULL ); 进入 C++ 时，我被卡住了。我无法在 API.

中找到相应的调用

如何通过 C++ 接口将 MPI 通信器正确地传递给 HDF5？

Answer 1

现阶段没有等效项，因为一些 MPI 调用尚未移植到 C++ API（根据最近的讨论，如 this one）。您必须记住，直到最近，C++ 层才支持 MPI。

您可能还想看看 htpp://h5cpp.ca，因为它也可能支持您的用例。

Answer 2

您可能想看看 HDFql，它完全支持并行 HDF5（即 HDF5+MPI）。它还可以减轻您 low-level 细节的负担，例如通过 H5Pset_fapl_mpio 设置某些参数（HDFql 会为您完成）。

您可以找到一个示例来说明如何在 C++ 中并行使用 HDFql（即 MPI）here。