为什么全息视图在 Spyder 中不显示直方图？

Question

我在 Windows 上安装了 Anaconda 3.7。它适用于 Jupyter 但不适用于 Spyder。此代码：

import holoviews as hv
import pandas as pd
import numpy as np
output_notebook ()
flora = pd.read_csv ('iris.csv')
hv.extension('bokeh')
frequencies, edges = np.histogram(flora['petal width'], bins = 5)
print(frequencies, edges)
hv.Histogram(frequencies, edges, label = 'Histogram')

returns 仅值：

[49  8 41 29 23] [0.1  0.58 1.06 1.54 2.02 2.5 ]
WARNING:root:Histogram: Histogram edges should be supplied as a tuple along with the values, passing the edges will be deprecated in holoviews 2.0.

是否可以在 Spyder 中查看直方图？

Answer 1

(此处为 Spyder 维护者) Holoviews 生成要在网络浏览器中呈现的内容，Spyder 控制台目前无法显示该内容，抱歉。

Answer 2

作为解决方法，您可以通过将 Holoviews 图形放入 Panel 对象并对其调用 .show() 来在浏览器中打开图形。
Library Panel 可用于在浏览器中创建带有 Holoviews 图表的仪表板。
这是一个工作示例：

# library imports
import numpy as np
import pandas as pd
import holoviews as hv
hv.extension('bokeh', logo=False)
import panel as pn

# create sample data
data = np.random.normal(size=[50, 2])
df = pd.DataFrame(data, columns=['col1', 'col2'])

# create holoviews graph
hv_plot = hv.Points(df)

# display graph in browser
# a bokeh server is automatically started
bokeh_server = pn.Row(hv_plot).show(port=12345)

# stop the bokeh server (when needed)
bokeh_server.stop()

另请参阅：

或者您可以将散景设置为渲染器的后端，然后使用 bokeh.render.show()。这将在浏览器中打开您的全息图：

import holoviews as hv
hv.extension('bokeh')
from bokeh.plotting import show

show(hv.render(your_holoviews_plot))

Answer 3

全息视图的美妙之处在于它允许您在基于现代浏览器的 bokeh 和熟悉的 matplotlib 之间进行选择显示它的图（以及 plotly 在某种程度上，主要用于 3D 图）。

Spyder 能够以内联方式（即在 python 控制台本身或最近是他们的新绘图面板）或交互方式（即在弹出窗口中 window - several backends exist, 在所有 qt) 中。您可以通过在您的 spyder ipython 控制台中输入 %matplotlib inline 或 %matplotlib qt 在它们之间切换。

这些后端将成为您的全息视图生成的 matplotlib 绘图的地方！

现在，您需要明确告诉 holoviews 使用 matplotlib 作为后端来渲染图（我在下面提到的 holoview_object 可以是他们所说的 'element' 或组合这些：布局、覆盖、全息图……）。您可以使用

matplotlib_fig = holoviews.render(holoview_object, backend='matplotlib')

然后创建一个空的 matplotlib 图并修改其管理器以将其显示在您的默认 matplotlib 后端中：

dummy = plt.figure()
new_manager = dummy.canvas.manager
new_manager.canvas.figure = matplotlib_fig
fig.set_canvas(new_manager.canvas)

使用上面的概念，我自己编写了一些实用函数，可以直接从 spyder 中直接或从 holoviews 对象开始显示 matplotlib 或散景图，请随意使用它们：

import matplotlib.pyplot as plt
import bokeh as bk
import holoviews as hv

def mplshow(fig):

    # create a dummy figure and use its
    # manager to display "fig"

    dummy = plt.figure()
    new_manager = dummy.canvas.manager
    new_manager.canvas.figure = fig
    fig.set_canvas(new_manager.canvas)

def bkshow(bkfig, title=None, save=0, savePath='~/Downloads'):
    if title is None: title=bkfig.__repr__()
    if save:bk.plotting.output_file(f'{title}.html')
    bk.plotting.show(bkfig)

def hvshow(hvobject, backend='matplotlib', return_mpl=True):
    '''
    Holoview utility which
    - for dynamic display, interaction and data exploration:
        in browser, pops up a holoview object as a bokeh figure
    - for static instanciation, refinement and data exploitation:
        in matplotlib current backend, pops up a holoview object as a matplotlib figure
        and eventually returns it for further tweaking.
    Parameters:
        - hvobject: a Holoviews object e.g. Element, Overlay or Layout.
        - backend: 'bokeh' or 'matplotlib', which backend to use to show figure
        - return_mpl: bool, returns a matplotlib figure
        
    '''
    assert backend in ['bokeh', 'matplotlib']
    if backend=='matplotlib' or return_mpl:
        mplfig=hv.render(hvobject, backend='matplotlib')
    if backend=='bokeh': bkshow(hv.render(hvobject, backend='bokeh'))
    elif backend=='matplotlib': mplshow(mplfig)
    if return_mpl: return mplfig

总结：如果您希望在 spyder 绘图窗格（或 python 控制台，如果您不使用它们的绘图窗格）静态渲染绘图，请执行：

%matplotlib inline
hvshow(holoviews_object, 'matplotlib')

如果你想在交互式 qt window 中弹出你的情节 ，请执行：

%matplotlib qt hvshow(holoviews_object, 'matplotlib')

如果你想在你的浏览器中弹出你的情节（即使用散景），也可以交互，做：

hvshow(holoviews_object, 'bokeh')

我喜欢 spyder（比 jupyter notebooks 多得多）和 holoviews 一样多，我很高兴能够同时使用两者！

为什么全息视图在 Spyder 中不显示直方图？

Why doesn't holoviews show histogram in Spyder?

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