如何从目录中的所有文件中剪切列并创建具有相同名称的新文件？

Question

我在一个目录下有32个文件。

每个文件的格式如下-

Sample geneA geneB

Name countsA countsB

我想剪切前两列并将它们粘贴到 geneA 的 32 个文件中，第一和第三列粘贴到 geneB 的文件中。

我尝试的是cut -f1,2 * > *_geneA.txt，其中输出中的*被当作一个字符。有没有办法一次搞定？

提前致谢。

Answer 1

这个 GNU awk 程序（参见评论中@EdMorton 的评论）从第一条记录中获取目标文件字段名，根据文件名和字段名创建文件并向其附加字段。在下面的示例中，我在文件 file1 和 file2:

中两次使用了您的示例数据

$ awk '
FNR==1 {                                # first record of each file
    for(i=2;i<=NF;i++)                  # iterate field names 
        f[i]=$i                         # and hash them to f
}
{                                       # for all records
    for(i=2;i<=NF;i++) {                # iterate all but first field
        file=FILENAME "_" f[i] ".txt"   # form the file name
        print ,$i > file              # and print to it
    }
}' file1 file2

让我们看看做了什么：

$ ls -rt | tail -n 4 
file1_geneB.txt
file1_geneA.txt
file2_geneB.txt
file2_geneA.txt

让我们看看里面的一个：

$ cat file1_geneA.txt
Sample geneA
Name countsA

如何从目录中的所有文件中剪切列并创建具有相同名称的新文件？

How to cut columns from all files in a directory and make new files with the same names?

grep

cut