roadoi 中的 UseMethod("http_error") 错误

Question

我正在尝试 roadoi 从 R 访问 Unpaywall，但无论我尝试查询什么，我都会收到以下响应：

Error in UseMethod("http_error") : no applicable method for 'http_error' applied to an object of class "c('simpleError', 'error', 'condition')"

运行 methods(http_error) 给我这个：

[1] http_error.character* http_error.integer*   http_error.response*

这可能是我在机构防火墙后面造成的吗？（即便如此，这会是回应似乎很奇怪......）

有办法解决吗？

Answer 1

http_error（实际上来自库 httr）是一个非常简单的函数：它加载一个由字符 (http_error.character) 给出的 url，检索响应(http_error.response) 并最终查看响应代码 (http_error.integer)。如果响应代码是 >=400 函数 returns TRUE 否则 FALSE.

您的错误说明，您（或链中的任何函数）试图在 simpleError 对象上调用 http_error。我的猜测是您的防火墙设置阻止了请求。因为请求被阻止，底层 httr::RETRY（从 oadoi_fetch 调用）returns 一个错误而不是正确的响应对象，并且 http_error 只看到这个错误对象并中断。

如果我在本地关闭我的代理（我可以通过它发出请求）我也会得到一个错误：

library(roadoi)
Sys.unsetenv(c("HTTP_PROXY", "HTTPS_PROXY"))
oadoi_fetch("10.1038/nature12373", email = "name@whatever.com")
# Error in UseMethod("http_error") : 
#   no applicable method for 'http_error' applied to an object of class
#   "c('simpleError', 'error', 'condition')"

只要我的代理设置正确，我就会得到

Sys.setenv(HTTPS_PROXY = my_proxy, HTTP_PROXY = my_proxy)
oadoi_fetch("10.1038/nature12373", email = "name@whatever.com")
# # A tibble: 1 x 16
#   doi      best_oa_location  oa_locations  data_standard is_oa genre   journal_is_oa journal_is_in_d~ journal_issns  journal_name publisher  title        year  updated    non_compliant authors  
#   <chr>    <list>            <list>                <int> <lgl> <chr>   <lgl>         <lgl>            <chr>          <chr>        <chr>      <chr>        <chr> <chr>      <list>        <list>   
# 1 10.1038~ <tibble [1 x 10]> <tibble [4 x~             2 TRUE  journa~ FALSE         FALSE            0028-0836,147~ Nature       Springer ~ Nanometre-s~ 2013  2019-04-0~

如果问题确实出在代理上，我会尝试以下方法，这对我的公司 Windows 机器有帮助，但可能取决于您的本地 IT 设置：

## get the proxy settings
system("netsh winhttp show proxy")
Sys.setenv(HTTP_PROXY = <the proxy from netsh>, HTTPS_PROXY = <the proxy from netsh>)

实际上，您可以轻松重现错误：

httr::http_error(simpleError("Cannot reach the page"))
# Error in UseMethod("http_error") : 
#   no applicable method for 'http_error' applied to an object of class 
#   "c('simpleError', # 'error', 'condition')"

roadoi 中的 UseMethod("http_error") 错误

Error in UseMethod("http_error") in roadoi

r

http-error