如果使用不是直接从 MPI_COMM_WORLD 创建的组,则 Fortran MPI_COMM_CREATE_GROUP 中的段错误

Seg fault in fortran MPI_COMM_CREATE_GROUP if using a group not directly created from MPI_COMM_WORLD

我有一个分段错误,我无法用简单的代码真正理解它,只是:

具体来说,我使用了最后一个调用,而不是仅使用 MPI_COMM_CREATE,因为它仅对 group 中包含的进程组进行集体调用,而 MPI_COMM_CREATE 对 COMM 中的每个进程进行集体调用。 代码如下

program mpi_comm_create_grp
  use mpi
  IMPLICIT NONE

  INTEGER :: mpi_size,  mpi_err_code
  INTEGER :: my_comm_dup, mpi_new_comm, mpi_group_world, mpi_new_group
  INTEGER :: rank_index
  INTEGER, DIMENSION(:), ALLOCATABLE :: rank_vec

  CALL mpi_init(mpi_err_code)
  CALL mpi_comm_size(mpi_comm_world, mpi_size, mpi_err_code)

  !! allocate and fill the vector for the new group
  allocate(rank_vec(mpi_size/2))
  rank_vec(:) = (/ (rank_index , rank_index=0, mpi_size/2) /)

  !! create the group directly from the comm_world: this way works
  ! CALL mpi_comm_group(mpi_comm_world, mpi_group_world, mpi_err_code)

  !! duplicating the comm_world creating the group form the dup: this ways fails
  CALL mpi_comm_dup(mpi_comm_world, my_comm_dup, mpi_err_code)
  !! creatig the group of all processes from the duplicated comm_world
  CALL mpi_comm_group(my_comm_dup, mpi_group_world, mpi_err_code)

  !! create a new group with just half of processes in comm_world
  CALL mpi_group_incl(mpi_group_world, mpi_size/2, rank_vec,mpi_new_group, mpi_err_code)

  !! create a new comm from the comm_world using the new group created
  CALL mpi_comm_create_group(mpi_comm_world, mpi_new_group, 0, mpi_new_comm, mpi_err_code)

  !! deallocate and finalize mpi
  if(ALLOCATED(rank_vec)) DEALLOCATE(rank_vec)
  CALL mpi_finalize(mpi_err_code)
end program !mpi_comm_create_grp

如果我不复制 COMM_WORLD,直接从全局通信器(注释行)创建组,一切正常。

我正在使用的并行调试器将段错误追溯到对 MPI_GROUP_TRANSLATE_RANKS 的调用,但据我所知,MPI_COMM_DUP 重复了 all被复制的通讯器属性,包含军衔编号

我使用的是 ifort 版本 18.0.5,但我也尝试过 17.0.4 和 19.0.2,但没有更好的结果。

事情有点棘手,至少对我来说是这样,但经过一些测试和帮助,找到了问题的根源。

代码中

CALL mpi_comm_create_group(mpi_comm_world, mpi_new_group, 0, mpi_new_comm, mpi_err_code)

为群组 mpi_new_group 创建一个新的通讯器,之前 创建。但是,用作第一个参数的 mpi_comm_worldmpi_new_group 不在同一上下文中,如 mpich reference:

中所述

MPI_COMM_DUP will create a new communicator over the same group as comm but with a new context

所以正确的调用是:

CALL mpi_comm_create_group(my_comm_copy, mpi_new_group, 0, mpi_new_comm, mpi_err_code)

即,将 mpi_comm_world 替换为 my_comm_copy,即创建 mpi_group_world 的那个。

我仍然不确定为什么它与 OpenMPI 一起工作,但它通常更宽容 诸如此类。

喜欢我写给 openmpi 用户列表的评论中的建议,他们回复了

That is perfectly valid. The MPI processes that make up the group are all part of comm world. I would file a bug with Intel MPI.

所以我尝试 post 在英特尔论坛上 question。 这是他们在最新版本的库 19.3 中解决的一个错误。