awk 代码输出具有匹配字段的行，但没有输出

Question

我试图在一个文件 fileB 中输出与另一个文件 fileA 中的参数匹配的行，但我的尝试没有输出任何内容。

fileA:

chr1    7237    7238
chr1    7637    7637
chr1    7908    7908
chr1    8045    8045
chr1    8329    8329
chr1    8358    8358
chr1    8375    8375
chr1    8381    8381

fileB：（注意第五行多了一列）

130 chr1    7237    7238    0k9imgkt
135 chr1    7637    7637    b9gko
138 chr1    7908    7908    kob9g
139 chr1    8045    8045    34e5rg  4r
151 chr1    8329    8329    b
151 chr1    8346    8346    345y46htyh
151 chr1    8346    8346    76jtuj
152 chr1    8358    8358    asfge

我的代码：

awk 'NR==FNR{a[,,];next}(,,) in a{print [=12=]}' fileA fileB

预期输出：

130 chr1    7237    7238    0k9imgkt
135 chr1    7637    7637    b9gko
138 chr1    7908    7908    kob9g
139 chr1    8045    8045    34e5rg  4r
151 chr1    8329    8329    b
152 chr1    8358    8358    asfge

实际输出：

Answer 1

当输入文件有 Windows 行结尾（即 \r\n）时会发生这种情况。使用 dos2unix 工具修复您的输入文件，您的命令将起作用。

dos2unix fileA fileB

或者，如果您使用的是 gawk 或 mawk，请将记录分隔符设置为 \r\n:

awk -v RS='\r\n' ...

Answer 2

您可以尝试使用 tr 和 grep :

< fileA tr -d '\r' | grep -f - fileB

awk 代码输出具有匹配字段的行，但没有输出

awk code to output lines with matching fields, but no output

awk

carriage-return