BLAST：blastpgp 未生成输出文件，不确定是否正确使用数据库标志
BLAST: blastpgp not producing an output file, unsure if using database flag correctly
问题 1：
我是运行以下的人：
blast-2.2.26/bin/blastpgp -i protein.fasta -j 5 -o file -d nr
其中 protein.fasta 是包含单个蛋白质序列的 fasta 文件。这不会产生任何输出并且 -o 文件为空。
问题 2：
我能够成功使用：
blast-2.2.26/bin/formatdb -i family_of_proteins.fas -o T -s T
创建数据库文件。但是，这会生成多个文件，.phr、.pin、.psd、.psi、.psq。我应该使用 -d 标志传递其中的哪一个来使用我自己的数据库？
谢谢！
对于问题 2：
您应该使用 -d 标志传递基本名称，因此在您的示例中，它将是“-d family_of_proteins.fas”
问题 1：
我是运行以下的人：
blast-2.2.26/bin/blastpgp -i protein.fasta -j 5 -o file -d nr
其中 protein.fasta 是包含单个蛋白质序列的 fasta 文件。这不会产生任何输出并且 -o 文件为空。
问题 2：
我能够成功使用：
blast-2.2.26/bin/formatdb -i family_of_proteins.fas -o T -s T
创建数据库文件。但是，这会生成多个文件，.phr、.pin、.psd、.psi、.psq。我应该使用 -d 标志传递其中的哪一个来使用我自己的数据库？
谢谢！
对于问题 2：
您应该使用 -d 标志传递基本名称，因此在您的示例中，它将是“-d family_of_proteins.fas”