使用 "fread",如何从 csv 中删除注释行?

Using "fread", how to eliminate comment line from csv?

我必须读取一个 CSV 文件,其中包含一些注释行(以 # 开头)以及数据行。 fread函数用于读取此CSV文件。

config <- fread("Configuration.csv")

此文件中的行数不固定,可能会更改。如何在没有这些注释行的情况下阅读 CSV。

提前致谢!!!

更新答案

我假设您正在使用 windows...如果是这样,您可以将 findstr 的结果提供给 fread()
原始答案的数据保存到 test.csv.

data.table::fread( cmd = 'findstr "^[^#]" test.csv', sep = "\n", header = FALSE )

#                V1
#1:  line,with,data
#2: line2,with,data

findstr /b /v test.csv 给出相同的结果

启用 linux 时,您可以(可能)将 grep 命令的输出传递给 fread()

旧答案

这个解决方案在只处理一个文件时不是很有帮助,但在使用 lapply()

读取多个文件时会有帮助
text = "line,with,data
#commentline,with,data
line2,with,data"

data.table::fread( text, sep = "\n", header = FALSE )[!grepl( "^#", V1 )]

您可以尝试在之前而不是之后使用 grep 清理数据:

config <- fread("grep -v '^#' Configuration.csv")

更新:

如果使用 fread() 的目的只是将数据转换为 data.table,您可以使用 read.table() 而不是默认 comment.char="#" 然后将结果转换为 data.table:

config <- as.data.table(read.table(header = TRUE, "Configuration.csv"))