使用 rpy2 将 NULL 从 Python 转换为 R

Convert NULL from Python to R using rpy2

在 R 中通常使用 NULL 值作为默认值。使用 Python 和 RPy2,如何明确提供 NULL 参数?

None不可转换(NotImplementedError),字符串'NULL'只会被转换成字符串,执行时会出错。

以使用 tsintermittent 包为例:

import numpy as np
from rpy2.robjects.packages import importr
from rpy2.robjects import numpy2ri

numpy2ri.activate()

tsintermittent = importr('tsintermittent')
crost = tsintermittent.crost

ts = np.random.randint(0,2,50) * np.random.randint(1,10,50)

# implicit ok, default w is NULL
# crost(ts)

# explicit - how to do it?
# RRunTimeError - non numeric argument
crost(ts, w='NULL')
# NotImplementedError
crost(ts, w=None)

问题可能是由于 NULL 中的引号引起的。无法用 rpy2 检查(因为有安装问题)。下面是与 pyper

一起使用的代码
from pyper import *
import numpy as np
r=R(use_pandas=True)
ts = np.random.randint(0,2,50) * np.random.randint(1,10,50)
r('library(tsintermittent)')
r.assign('ts1', ts)
r('out <- crost(ts1, w = NULL)')
out1 = r.get('out')
out1.keys()
#['frc.out', 'initial', 'weights', 'components', 'model', 'frc.in']

无法用 rpy2 测试问题。可能反引号是一个选项,可以按原样阅读它

crost(ts, w = `NULL`)

您可以使用 r 对象导入 as.null,然后调用该函数。例如:

from rpy2.robjects import r

as_null = r['as.null']
is_null = r['is.null']
print(is_null(as_null())) #prints TRUE

我没有尝试你的代码,因为它的所有依赖项,但如果 as_null 定义如上,你应该可以使用

crost(ts, w=as_null())

或者,使用直接来自robjectsNULL对象定义:

import rpy2.robjects as robj

print(is_null(robj.NULL)) #prints TRUE