加载 .rda 文件并遍历其对象

Question

我加载了一个 rda 文件，它基本上是一个数据帧列表。我如何遍历 is 对象？

>load(data)
>attach(data)
 The following objects are masked _by_ .GlobalEnv:

GSE109597, GSE18897, GSE32575, GSE53232, GSE55205, GSE69039,
GSE83223, GSE87493, GSE98895
> R » objects()
[1] "GSE109597" "GSE18897"  "GSE32575"  "GSE53232"  "GSE55205"  "GSE69039" 
[7] "GSE83223"  "GSE87493"  "GSE98895"

Answer 1

两个想法：

显式加载到一个新的空环境中，然后在那里处理它们：

e <- new.env(parent = emptyenv())
load(filename, envir = e)
out <- eapply(e, function(x) {
  # do something with x
})

从?load，它returns一个"character vector of the names of objects created, invisibly"。如果您捕获（不可见的）矢量，您应该能够执行以下操作：

nms <- load(data)
for (nm in nms) {
  x <- get(nm)
  # do something with x
  # optional, save it back with assign(nm, x)
}
# or to capture all data into a list (similar to bullet 1 above)
out <- lapply(lapply(nms, get), function(x) {
  # do something with x
})

出于以下几个原因，我更喜欢第一个（基于环境的）解决方案：

它将永远不会覆盖.GlobalEnv中的任何东西......已经了解到有时无法重现的问题 , 这对我来说太重要了
它鼓励一种类似列表的做事方式，当 .rda 文件中的大多数或所有对象都相同时更重要 "thing" （例如，框架，列表）和我计划对他们每个人执行相同的操作
如果对数据源有任何疑问，它不会弄乱我的任何命名空间或全局环境

加载 .rda 文件并遍历其对象

Load a .rda file and iterate over its objects

r

rda