如何使用 FitsIO 更新 FITS 文件 header？

Question

我目前正在尝试修改 FITS 文件的 header。更具体地说，我想为其添加新的关键字。我与 FitsIO 一起工作 python，版本为 0.9.11.

在一些数据处理过程中，我的程序创建了新的 FITS 文件并更新了它们的内容和 header。我曾经使用 Astropy，但这不再是一种选择，所以我又回到了 FitsIO，这对我来说是一个很大的挑战。

内容 update/overwrite 相当简单，但我对 header 的修改有困难。为了隔离我的问题，并找到正确的过程（文档不是很有帮助），我创建了一个小程序，只测试如何编写 header.

作为输入数据，我使用包含以下内容的 FITSHDR object：

update_data = fitsio.FITSHDR([
"IVAL    =                   36 / integer value           ",
"SHORTS  = 'hello w'                                      ",
"DBL     =                 1.25                           ",
"CDELT1  =                 0.00333333333333               "])

下面是经过测试的函数：

def write_hdu_1(data, fits_file):
    with fitsio.FITS(fits_file, 'rw', clobber=True) as fits:
        fits[extension].write_keys(data)

结果：删除END卡，破坏HDU。

def write_hdu_2(data, fits_file):
   with fitsio.FITS(fits_file, 'rw', clobber=True) as fits:
       for key in data.keys():
           fits[extension].write_key(key, data.get(key))

结果：删除END卡，破坏HDU。

def write_hdu_3(fits_file):
    with fitsio.FITS(fits_file, 'rw', clobber=True) as fits:
        keydict = { 'name':'test', 'value':35, 'comment':'keydict test'}
        fits[-1].write_key(**keydict)

结果：

File "test_fitsio.py", line 26, in write_hdu_3
    fits[-1].write_key(**keydict)
TypeError: write_key() got an unexpected keyword argument 'name'

无奈之下，我终于手动添加了"END"卡，像这样：

def write_hdu(self, header_content):
    self.fits[extension].write_keys(header_content)
    self.fits[extension].write_key('END', '')

但是，END 卡随后用空格填充，我正在使用的其他库无法正确识别它。

那么，对于如何使用 python FitsIO add/update header 关键字，并且在此过程中不丢失 "END" 卡，您有什么后见之明吗？

谢谢！

Answer 1

打开文件时删除 clobber 选项，header 版本将可用。 clobber 选项用于在打开文件之前删除任何现有文件，请参阅 docstring and the code 实现。

在我这边，这对 Python3 中的 fitsio 0.9.11 很有用：

with fitsio.FITS('test.fits', 'rw') as ff:
    ff[-1].write_key('KEY', 'key value', 'my comment')

另一方面，在现有文件上使用相同的代码在给定的 HDU 中附加关键字 header 如果您使用 clobber 选项，则从磁盘中删除文件。

$ du -sh test.fits                                                                                           
308K    test.fits
$ python3 -c "import fitsio; ff = fitsio.FITS('test.fits', 'rw', clobber=True); ff[-1].write_key('KEY', 'key value', 'my comment')"
$ du -sh test.fits                                                                                  
4.0K    test.fits
$ cat test.fits
KEY     = 'key value'          / my comment                                     END

这是一个非常奇怪的结果，但是 fitsio 附加了 END 关键字但是在一个空文件上，如果不是有效的 FITS 文件。

如何使用 FitsIO 更新 FITS 文件 header？

How to update a FITS file header using FitsIO?

python

python-3.x

fits