Python 中包含大量组的 Anova 测试

Question

我有一个相对较大的数据集（大约 273,744 条记录），其中包含人名和他们使用的屈光力：

Name   | Dioptric | Gender | Town |
-----------------------------------
'John' |  0.25    |   M    |  A   |
'Jack' |  0.5     |   M    |  C   |
'John' |  25      |   M    |  A   |
'Mary' |  0.25    |   F    |  C   |
........

我需要查明名字和屈光力之间是否存在相关性。我决定使用方差分析检验，因为有一个分类变量和一个定量变量。我的问题是数据集包含大量名称屈光度组（大约 21,000 个），因此我不太确定如何实现

stats.f_oneway( Name_Dioptrics_GroupA, Name_Dioptrics_GroupB,....)

到目前为止我所做的是：

从 csv 中将数据作为 numpy 数据帧导入
尝试根据名称屈光度分组


import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
import scipy.stats as stats

# read data
data = pd.read_csv("dioptrics-to-name.csv")

# prepare data
dioptrics = data['value']
name = data['firstName']

"""
group based on name-dioptrics power
"""
name_dioptric_frame = pd.DataFrame({"Name":name,"dioptrics":dioptrics})
name_dioptrics_groups = name_dioptric_frame.groupby("Name").groups

## break into name-dioptrics groups
## name_dioptrics_GroupA = dioptrics[name_dioptrics_groups["John"]]
## name_dioptrics_GroupB = dioptrics[name_dioptrics_groups["Jamie"]] 
## and so on ....

print(stats.f_oneway( dioptrics[name_dioptrics_groups[ name_dioptrics_groups.keys()] ]) ) 
print(stats.f_oneway( dioptrics[name_dioptrics_groups[ [ name for x in name_dioptrics_groups() ] ] ]) )

这当然行不通...我在这里采取的方法是否正确？

Answer 1

Pandas groupby 函数允许您按多列对数据框进行分组。如果您使用列列表而不是一列，则可以使用此功能：

df = pd.DataFrame([
    ['WAKA', 2, '1'],
    ['WAKA-WAKA', 3, '7'],
    ['WAKKA', 1, '0'],
    ['WAKA', 2, '1'],
    ['WAKA-WAKA', 1, '7'],
    ['WAKKA', 1, '1'],
    ['WAKA', 5, '1'],
    ['WAKA-WAKA', 3, '7'],
    ['WAKKA', 1, '2'],
])
df.columns = ['name', 'd', 'info']

df.groupby(['name', 'd']).groups

会 return:

{('WAKA', 2): Int64Index([0, 3], dtype='int64'),
 ('WAKA', 5): Int64Index([6], dtype='int64'),
 ('WAKA-WAKA', 1): Int64Index([4], dtype='int64'),
 ('WAKA-WAKA', 3): Int64Index([1, 7], dtype='int64'),
 ('WAKKA', 1): Int64Index([2, 5, 8], dtype='int64')}

在您的代码中，您试图仅按名称分组，没有屈光度。

Python 中包含大量组的 Anova 测试

Anova test in Python with a very large number of Groups

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