如何用R计算两个数据框之间的Jaccard相似度

Question

我有两个二进制数据帧c(0,1)，我没有找到任何计算两个数据帧之间的 Jaccard 相似系数的方法。我见过在单个数据框的列之间进行这种计算的方法。
让我们说 DF1

DF1 <- data.frame(a=c(0,0,1,0),
                  b=c(1,0,1,0),
                  c=c(1,1,1,1))

和DF2：

DF2 <- data.frame(a=c(0,0,0,0),
                  b=c(1,0,1,0),
                  c=c(1,0,1,1))

我看的是两个数据帧之间的单个Jaccard相似系数（不是逐列的）

你能帮我解决这个问题吗？

Answer 1

这就是你想要的：

DF1<-data.frame(a=c(0, 0, 1, 0),
           b=c(1,0,1,0),
           c=c(1,1,1,1))

DF2<-data.frame(a=c(0,0,0,0),
               b=c(1,0,1,0),
               c=c(1,0,1,1))

install.packages("vegdist")
library(vegdist)
vegdist(rbind(unlist(DF1, use.names=F),unlist(DF2, use.names=F)), method = "jaccard")

Answer 2

您可以使用 dist：

dist(t(cbind(unlist(DF1), unlist(DF2))), "binary")
# 0.2857143

DF2 <- as.data.frame(xor(DF1, 1) +0L) 的距离为 1，DF2 <- DF1 的距离为 0。

如何用R计算两个数据框之间的Jaccard相似度

How to calculate Jaccard similarity between two data frame with in R

r

similarity

dataframe