skbio 模块的 ImportError
ImportError for skbio module
我是 运行ning Python 3 并且安装了 skbio v0.5.5。按照 this tutorial 中的示例，我正在尝试 运行 某些 skbio 类 的导入语句，但出现错误。例如，
from skbio.alignment import Alignment
结果
ImportError: cannot import name 'Alignment' from 'skbio.alignment'
此外，
from skbio import BiologicalSequence
结果
ImportError: cannot import name 'Alignment' from 'BiologicalSequence'
我该如何解决这个问题？
Alignment class 来自旧版本的 skbio 库，特别是 0.3 之前的版本。
如果您想使用那些 classes，您需要安装该版本之前的 scikit-bio，方法如下：
pip install scikit-bio==0.2
如果您只是阅读《应用生物信息学概论》一书，就像您在评论中提到的那样，最好 use the latest version of the book instead，它将使用最新版本的 scikit-bio 库。
我是 运行ning Python 3 并且安装了 skbio v0.5.5。按照 this tutorial 中的示例，我正在尝试 运行 某些 skbio 类 的导入语句，但出现错误。例如，
from skbio.alignment import Alignment
结果
ImportError: cannot import name 'Alignment' from 'skbio.alignment'
此外，
from skbio import BiologicalSequence
结果
ImportError: cannot import name 'Alignment' from 'BiologicalSequence'
我该如何解决这个问题？
Alignment class 来自旧版本的 skbio 库，特别是 0.3 之前的版本。
如果您想使用那些 classes，您需要安装该版本之前的 scikit-bio，方法如下：
pip install scikit-bio==0.2
如果您只是阅读《应用生物信息学概论》一书，就像您在评论中提到的那样，最好 use the latest version of the book instead，它将使用最新版本的 scikit-bio 库。