R Vignette 在内部包功能上失败

Question

我们正在向我们的 R 包中添加一个小插图。使用 roxygen2 记录包时，小插图中断并给出错误

Error in tMatrix[i, j, ] <- testVec : 
  number of items to replace is not a multiple of replacement length

但是，使用 devtools::document() 或 devtools::build_vignettes()，小插图构建良好。

最小示例位于 here。

Answer 1

这是因为 R 在构建包时将 LC_COLLATE 设置为 C，这通常 而不是 常见操作系统区域设置的整理顺序，例如正如你在 Github issue yihui/knitr#1719. Because you used sort() in the makeArray() function in your minimal example 中提到的那样，sort() depends on LC_COLLATE，你会得到不同的结果你的 R 控制台（其中 LC_COLLATE 通常不是 C）和 R CMD build。要重现错误：

# Copied from https://github.com/GilChrist19/vignetteExample/blob/8973dbc/vignetteExample/R/array.R#L8-L45
makeArray <- function(names = c("AA", "Aa", "aa")){


  size <- length(names)
  tMatrix <- array(data=0, dim=c(size, size, size), dimnames=list(names, names, names))
  testVec <- setNames(object = numeric(size), nm = names)

  # fill up the array
  for (i in names)
  {
    for (j in names)
    {

      j_name <- strsplit(j, split='')[[1]]
      i_name <- strsplit(i, split='')[[1]]
      ij_prod <- as.vector( outer(j_name, i_name, paste0, sep='') )

      # sort
      ij_prod <- vapply( strsplit(ij_prod, split=''),
                           function(x) {paste0(sort(x, decreasing=TRUE), collapse='')},
                           FUN.VALUE = character(1))

      for (k in ij_prod)
      {
        testVec[k] <- testVec[k]+5
      }

      # testVec[] <- testVec/sum(testVec)

      tMatrix[i,j, ] <- testVec

      testVec[] <- 0
    }
  }


  return(tMatrix)
}


Sys.setlocale('LC_COLLATE', 'C')
makeArray()

由于我不熟悉您的功能，因此我将让您决定如何处理 sort()。我可以给出的一个提示是 sort(method = 'radix') 始终遵循 C 语言环境，因此对不同的语言环境更加稳健。

R Vignette 在内部包功能上失败

R Vignette Fails on Internal Package Function

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