如何在R中执行countif并导出数据？

Question

我有一组数据：

ID<-c(111,111,222,222,222,222,222,222)
TreatmentDate<-as.Date(c("2010-12-12","2011-12-01","2009-8-7","2010-5-7","2011-3-7","2011-8-5","2013-8-27","2016-9-3"))
Treatment<-c("AA","BB","CC","DD","AA","BB","BB","CC")
df<-data.frame(ID,TreatmentDate,Treatment)
df

ID   TreatmentDate   Treatment
111   12/12/2010     AA
111   01/12/2011     BB
222   07/08/2009     CC
222   07/05/2010     DD
222   07/03/2011     AA
222   05/08/2011     BB
222   27/08/2013     BB
222   03/09/2016     CC

我还有另一个数据框显示每个科目的考试日期：

UID<-c(111,222)
Testdate<-as.Date(c("2012-12-31","2014-12-31"))
SubjectTestDate<-data.frame(UID,Testdate)

我正在尝试总结数据，例如，如果我想查看受试者在测试日期之前接受了多少次治疗，我会得到类似这样的信息，并且我想将其导出到电子表格中。

ID     Prior_to_date      TreatmentAA   TreatmentBB    TreatmentCC    TreatmentDD
111       31/12/2012           1             1              0              0
222       31/12/2014           1             2              1              1

任何帮助将不胜感激！！

Answer 1

我们可以使用 'ID' 连接两个数据集，创建一个检查条件的列 ('indx')，然后使用 dcast 将 'long' 转换为 'wide'格式

library(data.table)#v1.9.5+
 dcast(setkey(setDT(df), ID)[SubjectTestDate][,
     indx:=sum(TreatmentDate <=Testdate) , list(ID, Treatment)], 
       ID+Testdate~ paste0('Treatment', Treatment), value.var='indx', length)
#    ID   Testdate TreatmentAA TreatmentBB TreatmentCC TreatmentDD
#1: 111 2012-12-31           1           1           0           0
#2: 222 2014-12-31           1           2           2           1

更新

基于修改后的'df'，我们加入'df'和'SubjectTestDate'，像以前一样创建'indx'列，还有一个序列列'Seq'，按 'ID' 和 'Treatment' 分组，使用 dcast，然后使用 unique

删除重复的 'ID' 行

  unique(dcast(setkey(setDT(df), ID)[SubjectTestDate][, 
    c('indx', 'Seq') := list(sum(TreatmentDate <= Testdate), 1:.N) ,
    .(ID, Treatment)], ID+ Seq+ Testdate ~ paste0('Treatment', 
            Treatment), value.var='indx', fill=0), by='ID')
  #    ID Seq   Testdate TreatmentAA TreatmentBB TreatmentCC TreatmentDD
  #1: 111   1 2012-12-31           1           1           0           0
  #2: 222   1 2014-12-31           1           2           1           1

如何在R中执行countif并导出数据？

How to perform countif in R and export the data?

r

export

countif

更新