在 Rmarkdown 中打印可读的因子分析输出

Printing readable factor analysis output in Rmarkdown

我必须在 Rmarkdown 文档(最终可以是 pdf、word 或 html)中打印可读的因子分析输出,而我在执行此操作时遇到了真正的麻烦。我有这个问题 here。我是 运行ning psych 版本 1.8.12.

下面是可重现的代码,但我也在这里提供了一个 github 存储库:

注意,当我 运行 results='markup' pdf 编译时,但 table 不可读:它打印乳胶代码。当我运行results='asis'时,返回错误! LaTeX Error: \caption outside float.

我对 kabel 和 texreg 等软件包不太熟悉。这些是一个选择吗? `


title: "Factor Analysis Test"
author: "Simon Kiss"
date: '2019-06-07'
output: pdf_document
---

```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
```

```{r}
library(psych)
```

```{r}
data('Thurstone')
```
```{r}
mod<-fa(Thurstone, 3)
```
```{r results='markup'} 
fa2latex(mod)
````

如果你想输出 table 确保先将其转换为数据帧。

title: "Factor Analysis Test"
author: "Simon Kiss"
date: '2019-06-07'
output: pdf_document
---

```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
```

```{r}
library(psych)
```

```{r}
data('Thurstone')
```

```{r}
mod<-fa(Thurstone, 3)
```
```{r results='markup'} 
knitr::kable(data.frame(psych::fa.sort(mod$loadings)[1:8,]))

在这种情况下,您需要将 fa2latex(mod) 的输出直接添加到文档中,而不是在 {r results='markup'} 中,然后生成 pdf 而不是 html 或医生。将下面的代码复制并粘贴到 Rmd 文档中,看看会发生什么。

---
output:
  pdf_document: default
  html_document: default
  word_document: default
---
title: "Factor Analysis Test"
author: "Simon Kiss"
date: '2019-06-07'
output: pdf_document
---

```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
```

```{r}
library(psych)
```

```{r}
data('Thurstone')
```

```{r}
mod<-fa(Thurstone, 3)
```

% Called in the psych package  fa2latex % Called in the psych package  mod 
\begin{table}[htpb]\caption{fa2latex}
\begin{center}
\begin{scriptsize} 
\begin{tabular} {l r r r r r r }
 \multicolumn{ 6 }{l}{ A factor analysis table from the psych package in R } \cr 
 \hline Variable  &   MR1  &  MR2  &  MR3  &  h2  &  u2  &  com \cr 
  \hline 
Sentences   &  \bf{ 0.90}  &  -0.03  &   0.04  &  0.82  &  0.18  &  1.01 \cr 
 Vocabulary   &  \bf{ 0.89}  &   0.06  &  -0.03  &  0.84  &  0.16  &  1.01 \cr 
 Sent.Completion   &  \bf{ 0.84}  &   0.03  &   0.00  &  0.74  &  0.26  &  1.00 \cr 
 First.Letters   &   0.00  &  \bf{ 0.85}  &   0.00  &  0.73  &  0.27  &  1.00 \cr 
 Four.Letter.Words   &  -0.02  &  \bf{ 0.75}  &   0.10  &  0.63  &  0.37  &  1.04 \cr 
 Suffixes   &   0.18  &  \bf{ 0.63}  &  -0.08  &  0.50  &  0.50  &  1.20 \cr 
 Letter.Series   &   0.03  &  -0.01  &  \bf{ 0.84}  &  0.73  &  0.27  &  1.00 \cr 
 Pedigrees   &  \bf{ 0.38}  &  -0.05  &  \bf{ 0.46}  &  0.51  &  0.49  &  1.96 \cr 
 Letter.Group   &  -0.06  &   0.21  &  \bf{ 0.63}  &  0.52  &  0.48  &  1.25 \cr 
\hline \cr SS loadings & 2.65 &  1.87 &  1.49 &  \cr  
\cr 
            \hline \cr 
MR1   & 1.00 & 0.59 & 0.53 \cr 
 MR2   & 0.59 & 1.00 & 0.52 \cr 
 MR3   & 0.53 & 0.52 & 1.00 \cr 
 \hline 
\end{tabular}
\end{scriptsize}
\end{center}
\label{default}
\end{table} 

错误在 fa2latex 输出中。由于某些奇怪的原因,它将 scriptsize 更改为 s\iptsize。 以下更改修复了输出:

```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
```

```{r}
library(psych)
```


```{r}
data('Thurstone')
```
```{r}
mod<-fa(Thurstone, 3)
```
```{r, results='asis'} 
a <- fa2latex(mod, silent = T)
cat(gsub('s\iptsize','scriptsize',a))
```

编辑

错误刚刚停止,我无法重现,不确定发生了什么。 突然

```{r, results='asis'} 
a <- fa2latex(mod, silent = F)
```

是否按预期工作

好吧,我想这是一个迟到的答案,但是“baap”包可以解决您的问题。您可以在表达不需要的载荷时创建 table 因子载荷。这在 Rmarkdown 格式中也能正常工作。