snakemake: 运行 一些任务在集群上，一些在本地
snakemake: Run some tasks on cluster and some locally
我正在使用 snakemake 来编排分析管道。有些任务非常小（例如创建一些符号链接），而其他任务则需要几个小时。有没有办法对其中一些使用 --cluster 但仅在本地执行其他一些？
localrules 就是这样做的。当下面的示例是 运行 和 --cluster 时，bar 个作业在集群中 运行，foo 个作业在本地 运行。
localrules: foo
rule foo:
...
rule bar:
...
我正在使用 snakemake 来编排分析管道。有些任务非常小（例如创建一些符号链接），而其他任务则需要几个小时。有没有办法对其中一些使用 --cluster 但仅在本地执行其他一些？
localrules 就是这样做的。当下面的示例是 运行 和 --cluster 时，bar 个作业在集群中 运行，foo 个作业在本地 运行。
localrules: foo
rule foo:
...
rule bar:
...