Graphviz：如何将 neato 用于带有子图集群的非常大的图？

Question

我有一个很大但不是很大（？）的图，有 13 个子图簇，包含大约 100 个节点和 3,147 条边。

Dot 在 Windows 上崩溃，在 Linux 上出现段错误。

This question 建议解决方案是使用 neato，而不是 dot.

Please note there are some quirks here ... only the DOT and FDP layout methods seem to support subgraphs

无论我放大多远，我的输出都是一个巨大的黑色意大利面球。所以我删除了所有的消息，只有一条消息，这表明子图看起来是相互嵌套绘制的。

它们绝对没有嵌套在源文件中；这是一个示例，更改了商业敏感名称：

digraph G {
       labelloc="t";    // place the label at the top (b seems to be default)
       label="XXX message passing";
         rankdir = "LR"
         newrank = "true"

         subgraph cluster_AAA {
              label="AAA"
              rank="same"

            AAA_1
          }

         subgraph cluster_BBB {
              label="BBB"
              rank="same"

            BBB_1
            BBB_2
          }

         subgraph cluster_CCC {
              label="CCC"
              rank="same"

            CCC_1
            CCC_2
            CCC_3
          }

这在句法上似乎是正确的（边在后面）。

因此，链接页面似乎是正确的：

only the DOT and FDP layout methods seem to support subgraphs

但是，我似乎也需要 neato 来制作大图。

我有哪些选择？

[Updtae] 我运行 fdp 并收到以下错误消息

Error: node "xxx" is contained in two non-comparable clusters "AAA" and "BBB"

这似乎提供了线索。真的是两个集群不能用一个节点名吗？

如果是这样，解决方案似乎是在节点名称之前加上集群名称...

Answer 1

所以我没有通用的解决方案来解决您的问题。但是你看过"mars"吗？它是一个命令行工具，专为使用具有非常大图形的 graphviz 程序而设计。您可以在这里找到它：https://github.com/marckhoury/mars

Graphviz：如何将 neato 用于带有子图集群的非常大的图？

Graphviz: how to use neato with very large graphs with subgraph clusters?

graphviz

neato